Protein–RNA interactions for Protein: O43752

STX6, Syntaxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX6O43752 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
STX6O43752 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
STX6O43752 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
STX6O43752 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
STX6O43752 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
STX6O43752 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
STX6O43752 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
STX6O43752 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
STX6O43752 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
STX6O43752 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
STX6O43752 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
STX6O43752 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
STX6O43752 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
STX6O43752 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
STX6O43752 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
STX6O43752 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
STX6O43752 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
STX6O43752 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
STX6O43752 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
STX6O43752 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
STX6O43752 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
STX6O43752 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
STX6O43752 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
STX6O43752 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
STX6O43752 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
STX6O43752 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
STX6O43752 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
STX6O43752 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
STX6O43752 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
STX6O43752 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
STX6O43752 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
STX6O43752 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
STX6O43752 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
STX6O43752 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
STX6O43752 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
STX6O43752 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
STX6O43752 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
STX6O43752 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
STX6O43752 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
STX6O43752 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
STX6O43752 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
STX6O43752 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
STX6O43752 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
STX6O43752 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
STX6O43752 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
STX6O43752 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
STX6O43752 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
STX6O43752 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
STX6O43752 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
STX6O43752 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
STX6O43752 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
STX6O43752 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
STX6O43752 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
STX6O43752 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
STX6O43752 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
STX6O43752 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
STX6O43752 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
STX6O43752 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
STX6O43752 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
STX6O43752 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
STX6O43752 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
STX6O43752 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
STX6O43752 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
STX6O43752 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
STX6O43752 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
STX6O43752 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
STX6O43752 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
STX6O43752 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
STX6O43752 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
STX6O43752 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
STX6O43752 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
STX6O43752 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
STX6O43752 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
STX6O43752 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
STX6O43752 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
STX6O43752 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
STX6O43752 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
STX6O43752 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
STX6O43752 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
STX6O43752 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
STX6O43752 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
STX6O43752 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
STX6O43752 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
STX6O43752 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
STX6O43752 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
STX6O43752 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
STX6O43752 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
STX6O43752 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
STX6O43752 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
STX6O43752 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
STX6O43752 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
STX6O43752 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
STX6O43752 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
STX6O43752 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
STX6O43752 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
STX6O43752 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
STX6O43752 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
STX6O43752 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
STX6O43752 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
STX6O43752 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms