Protein–RNA interactions for Protein: O43752

STX6, Syntaxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX6O43752 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
STX6O43752 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.84■■■■□ 3.81
STX6O43752 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
STX6O43752 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC38.4■■■■□ 3.74
STX6O43752 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
STX6O43752 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC38.26■■■■□ 3.72
STX6O43752 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
STX6O43752 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
STX6O43752 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
STX6O43752 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
STX6O43752 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
STX6O43752 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
STX6O43752 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
STX6O43752 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
STX6O43752 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
STX6O43752 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
STX6O43752 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
STX6O43752 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC36.75■■■■□ 3.47
STX6O43752 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
STX6O43752 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
STX6O43752 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
STX6O43752 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
STX6O43752 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
STX6O43752 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
STX6O43752 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
STX6O43752 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
STX6O43752 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
STX6O43752 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
STX6O43752 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
STX6O43752 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
STX6O43752 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
STX6O43752 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
STX6O43752 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
STX6O43752 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
STX6O43752 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
STX6O43752 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
STX6O43752 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
STX6O43752 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
STX6O43752 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
STX6O43752 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
STX6O43752 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
STX6O43752 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
STX6O43752 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
STX6O43752 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
STX6O43752 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
STX6O43752 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
STX6O43752 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
STX6O43752 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
STX6O43752 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
STX6O43752 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
STX6O43752 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
STX6O43752 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
STX6O43752 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
STX6O43752 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
STX6O43752 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
STX6O43752 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
STX6O43752 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
STX6O43752 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
STX6O43752 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
STX6O43752 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
STX6O43752 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
STX6O43752 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
STX6O43752 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
STX6O43752 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
STX6O43752 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
STX6O43752 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
STX6O43752 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
STX6O43752 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
STX6O43752 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
STX6O43752 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
STX6O43752 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
STX6O43752 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
STX6O43752 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
STX6O43752 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
STX6O43752 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
STX6O43752 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
STX6O43752 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
STX6O43752 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
STX6O43752 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
STX6O43752 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
STX6O43752 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
STX6O43752 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
STX6O43752 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
STX6O43752 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
STX6O43752 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
STX6O43752 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
STX6O43752 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
STX6O43752 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
STX6O43752 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
STX6O43752 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3
STX6O43752 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
STX6O43752 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
STX6O43752 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
STX6O43752 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
STX6O43752 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
STX6O43752 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
STX6O43752 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
STX6O43752 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
STX6O43752 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
STX6O43752 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms