Protein–RNA interactions for Protein: O15533

TAPBP, Tapasin, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAPBPO15533 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TAPBPO15533 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAPBPO15533 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAPBPO15533 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAPBPO15533 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TAPBPO15533 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TAPBPO15533 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TAPBPO15533 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAPBPO15533 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAPBPO15533 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TAPBPO15533 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAPBPO15533 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAPBPO15533 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAPBPO15533 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAPBPO15533 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAPBPO15533 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAPBPO15533 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAPBPO15533 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAPBPO15533 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TAPBPO15533 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAPBPO15533 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAPBPO15533 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAPBPO15533 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAPBPO15533 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAPBPO15533 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAPBPO15533 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAPBPO15533 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAPBPO15533 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAPBPO15533 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
TAPBPO15533 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAPBPO15533 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAPBPO15533 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAPBPO15533 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAPBPO15533 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TAPBPO15533 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAPBPO15533 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAPBPO15533 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAPBPO15533 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAPBPO15533 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAPBPO15533 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAPBPO15533 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAPBPO15533 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAPBPO15533 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAPBPO15533 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAPBPO15533 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAPBPO15533 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAPBPO15533 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAPBPO15533 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAPBPO15533 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TAPBPO15533 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAPBPO15533 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAPBPO15533 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TAPBPO15533 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAPBPO15533 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAPBPO15533 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAPBPO15533 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAPBPO15533 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAPBPO15533 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAPBPO15533 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAPBPO15533 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAPBPO15533 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAPBPO15533 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAPBPO15533 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAPBPO15533 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAPBPO15533 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAPBPO15533 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAPBPO15533 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAPBPO15533 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAPBPO15533 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TAPBPO15533 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAPBPO15533 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAPBPO15533 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAPBPO15533 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAPBPO15533 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAPBPO15533 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAPBPO15533 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAPBPO15533 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAPBPO15533 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAPBPO15533 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAPBPO15533 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAPBPO15533 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TAPBPO15533 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAPBPO15533 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAPBPO15533 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAPBPO15533 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAPBPO15533 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAPBPO15533 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAPBPO15533 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAPBPO15533 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAPBPO15533 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAPBPO15533 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAPBPO15533 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAPBPO15533 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAPBPO15533 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAPBPO15533 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAPBPO15533 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAPBPO15533 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAPBPO15533 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms