Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SLC27A2O14975 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SLC27A2O14975 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC27A2O14975 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC27A2O14975 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC27A2O14975 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC27A2O14975 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC27A2O14975 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC27A2O14975 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC27A2O14975 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC27A2O14975 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC27A2O14975 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC27A2O14975 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC27A2O14975 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC27A2O14975 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC27A2O14975 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC27A2O14975 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC27A2O14975 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC27A2O14975 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC27A2O14975 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC27A2O14975 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC27A2O14975 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC27A2O14975 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC27A2O14975 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC27A2O14975 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC27A2O14975 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC27A2O14975 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC27A2O14975 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC27A2O14975 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC27A2O14975 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC27A2O14975 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC27A2O14975 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC27A2O14975 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC27A2O14975 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC27A2O14975 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
SLC27A2O14975 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC27A2O14975 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC27A2O14975 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC27A2O14975 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC27A2O14975 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC27A2O14975 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC27A2O14975 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC27A2O14975 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC27A2O14975 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC27A2O14975 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC27A2O14975 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC27A2O14975 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC27A2O14975 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC27A2O14975 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC27A2O14975 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC27A2O14975 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC27A2O14975 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC27A2O14975 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC27A2O14975 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC27A2O14975 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC27A2O14975 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC27A2O14975 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC27A2O14975 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC27A2O14975 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC27A2O14975 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC27A2O14975 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC27A2O14975 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC27A2O14975 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC27A2O14975 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC27A2O14975 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC27A2O14975 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC27A2O14975 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC27A2O14975 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC27A2O14975 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC27A2O14975 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC27A2O14975 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC27A2O14975 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC27A2O14975 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC27A2O14975 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC27A2O14975 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC27A2O14975 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC27A2O14975 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC27A2O14975 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC27A2O14975 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC27A2O14975 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC27A2O14975 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC27A2O14975 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC27A2O14975 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
SLC27A2O14975 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SLC27A2O14975 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SLC27A2O14975 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLC27A2O14975 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLC27A2O14975 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLC27A2O14975 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLC27A2O14975 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC27A2O14975 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC27A2O14975 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC27A2O14975 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC27A2O14975 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC27A2O14975 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC27A2O14975 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC27A2O14975 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC27A2O14975 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC27A2O14975 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC27A2O14975 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms