Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NOP58Q9Y2X3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NOP58Q9Y2X3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NOP58Q9Y2X3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NOP58Q9Y2X3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NOP58Q9Y2X3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NOP58Q9Y2X3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NOP58Q9Y2X3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NOP58Q9Y2X3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NOP58Q9Y2X3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
NOP58Q9Y2X3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NOP58Q9Y2X3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NOP58Q9Y2X3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
NOP58Q9Y2X3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NOP58Q9Y2X3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NOP58Q9Y2X3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
NOP58Q9Y2X3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
NOP58Q9Y2X3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NOP58Q9Y2X3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NOP58Q9Y2X3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
NOP58Q9Y2X3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
NOP58Q9Y2X3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
NOP58Q9Y2X3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
NOP58Q9Y2X3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
NOP58Q9Y2X3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
NOP58Q9Y2X3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NOP58Q9Y2X3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NOP58Q9Y2X3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NOP58Q9Y2X3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
NOP58Q9Y2X3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
NOP58Q9Y2X3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NOP58Q9Y2X3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NOP58Q9Y2X3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NOP58Q9Y2X3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
NOP58Q9Y2X3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NOP58Q9Y2X3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NOP58Q9Y2X3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NOP58Q9Y2X3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NOP58Q9Y2X3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NOP58Q9Y2X3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NOP58Q9Y2X3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NOP58Q9Y2X3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NOP58Q9Y2X3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NOP58Q9Y2X3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NOP58Q9Y2X3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NOP58Q9Y2X3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NOP58Q9Y2X3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.55
NOP58Q9Y2X3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
NOP58Q9Y2X3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
NOP58Q9Y2X3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
NOP58Q9Y2X3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
NOP58Q9Y2X3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
NOP58Q9Y2X3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
NOP58Q9Y2X3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NOP58Q9Y2X3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NOP58Q9Y2X3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NOP58Q9Y2X3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NOP58Q9Y2X3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
NOP58Q9Y2X3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NOP58Q9Y2X3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
NOP58Q9Y2X3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NOP58Q9Y2X3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NOP58Q9Y2X3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NOP58Q9Y2X3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NOP58Q9Y2X3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NOP58Q9Y2X3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NOP58Q9Y2X3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NOP58Q9Y2X3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NOP58Q9Y2X3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NOP58Q9Y2X3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NOP58Q9Y2X3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NOP58Q9Y2X3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NOP58Q9Y2X3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NOP58Q9Y2X3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NOP58Q9Y2X3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NOP58Q9Y2X3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NOP58Q9Y2X3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NOP58Q9Y2X3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NOP58Q9Y2X3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NOP58Q9Y2X3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
NOP58Q9Y2X3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
NOP58Q9Y2X3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
NOP58Q9Y2X3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
NOP58Q9Y2X3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
NOP58Q9Y2X3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
NOP58Q9Y2X3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.53
NOP58Q9Y2X3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
NOP58Q9Y2X3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NOP58Q9Y2X3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NOP58Q9Y2X3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NOP58Q9Y2X3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NOP58Q9Y2X3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NOP58Q9Y2X3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NOP58Q9Y2X3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NOP58Q9Y2X3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NOP58Q9Y2X3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NOP58Q9Y2X3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NOP58Q9Y2X3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NOP58Q9Y2X3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NOP58Q9Y2X3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms