Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SCHIP1Q9P0W5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SCHIP1Q9P0W5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCHIP1Q9P0W5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCHIP1Q9P0W5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCHIP1Q9P0W5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCHIP1Q9P0W5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCHIP1Q9P0W5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCHIP1Q9P0W5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCHIP1Q9P0W5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SCHIP1Q9P0W5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCHIP1Q9P0W5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCHIP1Q9P0W5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCHIP1Q9P0W5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCHIP1Q9P0W5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCHIP1Q9P0W5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCHIP1Q9P0W5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCHIP1Q9P0W5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCHIP1Q9P0W5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCHIP1Q9P0W5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCHIP1Q9P0W5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCHIP1Q9P0W5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCHIP1Q9P0W5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SCHIP1Q9P0W5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SCHIP1Q9P0W5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SCHIP1Q9P0W5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCHIP1Q9P0W5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SCHIP1Q9P0W5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCHIP1Q9P0W5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SCHIP1Q9P0W5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCHIP1Q9P0W5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCHIP1Q9P0W5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCHIP1Q9P0W5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCHIP1Q9P0W5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCHIP1Q9P0W5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCHIP1Q9P0W5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCHIP1Q9P0W5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCHIP1Q9P0W5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCHIP1Q9P0W5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SCHIP1Q9P0W5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCHIP1Q9P0W5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCHIP1Q9P0W5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCHIP1Q9P0W5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCHIP1Q9P0W5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCHIP1Q9P0W5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCHIP1Q9P0W5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SCHIP1Q9P0W5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCHIP1Q9P0W5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCHIP1Q9P0W5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCHIP1Q9P0W5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCHIP1Q9P0W5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCHIP1Q9P0W5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCHIP1Q9P0W5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCHIP1Q9P0W5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCHIP1Q9P0W5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCHIP1Q9P0W5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SCHIP1Q9P0W5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCHIP1Q9P0W5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCHIP1Q9P0W5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SCHIP1Q9P0W5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCHIP1Q9P0W5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCHIP1Q9P0W5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCHIP1Q9P0W5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCHIP1Q9P0W5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCHIP1Q9P0W5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCHIP1Q9P0W5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCHIP1Q9P0W5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCHIP1Q9P0W5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCHIP1Q9P0W5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCHIP1Q9P0W5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCHIP1Q9P0W5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCHIP1Q9P0W5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCHIP1Q9P0W5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCHIP1Q9P0W5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCHIP1Q9P0W5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCHIP1Q9P0W5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCHIP1Q9P0W5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCHIP1Q9P0W5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCHIP1Q9P0W5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SCHIP1Q9P0W5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCHIP1Q9P0W5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCHIP1Q9P0W5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCHIP1Q9P0W5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCHIP1Q9P0W5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCHIP1Q9P0W5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCHIP1Q9P0W5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCHIP1Q9P0W5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCHIP1Q9P0W5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCHIP1Q9P0W5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SCHIP1Q9P0W5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCHIP1Q9P0W5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SCHIP1Q9P0W5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCHIP1Q9P0W5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCHIP1Q9P0W5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCHIP1Q9P0W5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCHIP1Q9P0W5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SCHIP1Q9P0W5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCHIP1Q9P0W5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SCHIP1Q9P0W5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCHIP1Q9P0W5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms