Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP1

DDX18, ATP-dependent RNA helicase DDX18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX18Q9NVP1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX18Q9NVP1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX18Q9NVP1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX18Q9NVP1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX18Q9NVP1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX18Q9NVP1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX18Q9NVP1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX18Q9NVP1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX18Q9NVP1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX18Q9NVP1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX18Q9NVP1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX18Q9NVP1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX18Q9NVP1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX18Q9NVP1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX18Q9NVP1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX18Q9NVP1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX18Q9NVP1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX18Q9NVP1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX18Q9NVP1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX18Q9NVP1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX18Q9NVP1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX18Q9NVP1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX18Q9NVP1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX18Q9NVP1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX18Q9NVP1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX18Q9NVP1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX18Q9NVP1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX18Q9NVP1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX18Q9NVP1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX18Q9NVP1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX18Q9NVP1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX18Q9NVP1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX18Q9NVP1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX18Q9NVP1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX18Q9NVP1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX18Q9NVP1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX18Q9NVP1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX18Q9NVP1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX18Q9NVP1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX18Q9NVP1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX18Q9NVP1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX18Q9NVP1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX18Q9NVP1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX18Q9NVP1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX18Q9NVP1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX18Q9NVP1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX18Q9NVP1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX18Q9NVP1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX18Q9NVP1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX18Q9NVP1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX18Q9NVP1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX18Q9NVP1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX18Q9NVP1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX18Q9NVP1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX18Q9NVP1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX18Q9NVP1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX18Q9NVP1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX18Q9NVP1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX18Q9NVP1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX18Q9NVP1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX18Q9NVP1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX18Q9NVP1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX18Q9NVP1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX18Q9NVP1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX18Q9NVP1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX18Q9NVP1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX18Q9NVP1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX18Q9NVP1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX18Q9NVP1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX18Q9NVP1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX18Q9NVP1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX18Q9NVP1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX18Q9NVP1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX18Q9NVP1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX18Q9NVP1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX18Q9NVP1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX18Q9NVP1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX18Q9NVP1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX18Q9NVP1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX18Q9NVP1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX18Q9NVP1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX18Q9NVP1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX18Q9NVP1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX18Q9NVP1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX18Q9NVP1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX18Q9NVP1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX18Q9NVP1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX18Q9NVP1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX18Q9NVP1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX18Q9NVP1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX18Q9NVP1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX18Q9NVP1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX18Q9NVP1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX18Q9NVP1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX18Q9NVP1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX18Q9NVP1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX18Q9NVP1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX18Q9NVP1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX18Q9NVP1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX18Q9NVP1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms