Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2I8

LRMDA, Leucine-rich melanocyte differentiation-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRMDAQ9H2I8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRMDAQ9H2I8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRMDAQ9H2I8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRMDAQ9H2I8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRMDAQ9H2I8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRMDAQ9H2I8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRMDAQ9H2I8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRMDAQ9H2I8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRMDAQ9H2I8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRMDAQ9H2I8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRMDAQ9H2I8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRMDAQ9H2I8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRMDAQ9H2I8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRMDAQ9H2I8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRMDAQ9H2I8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LRMDAQ9H2I8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRMDAQ9H2I8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRMDAQ9H2I8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRMDAQ9H2I8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRMDAQ9H2I8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRMDAQ9H2I8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRMDAQ9H2I8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRMDAQ9H2I8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRMDAQ9H2I8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRMDAQ9H2I8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRMDAQ9H2I8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRMDAQ9H2I8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRMDAQ9H2I8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRMDAQ9H2I8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRMDAQ9H2I8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRMDAQ9H2I8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRMDAQ9H2I8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRMDAQ9H2I8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRMDAQ9H2I8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRMDAQ9H2I8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRMDAQ9H2I8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRMDAQ9H2I8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRMDAQ9H2I8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRMDAQ9H2I8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRMDAQ9H2I8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRMDAQ9H2I8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRMDAQ9H2I8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRMDAQ9H2I8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRMDAQ9H2I8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRMDAQ9H2I8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRMDAQ9H2I8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRMDAQ9H2I8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRMDAQ9H2I8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRMDAQ9H2I8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRMDAQ9H2I8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LRMDAQ9H2I8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRMDAQ9H2I8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRMDAQ9H2I8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRMDAQ9H2I8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LRMDAQ9H2I8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRMDAQ9H2I8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRMDAQ9H2I8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRMDAQ9H2I8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRMDAQ9H2I8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRMDAQ9H2I8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRMDAQ9H2I8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRMDAQ9H2I8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRMDAQ9H2I8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRMDAQ9H2I8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRMDAQ9H2I8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRMDAQ9H2I8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LRMDAQ9H2I8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRMDAQ9H2I8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRMDAQ9H2I8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRMDAQ9H2I8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRMDAQ9H2I8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRMDAQ9H2I8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LRMDAQ9H2I8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRMDAQ9H2I8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRMDAQ9H2I8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LRMDAQ9H2I8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRMDAQ9H2I8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRMDAQ9H2I8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRMDAQ9H2I8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRMDAQ9H2I8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRMDAQ9H2I8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LRMDAQ9H2I8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRMDAQ9H2I8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRMDAQ9H2I8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRMDAQ9H2I8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRMDAQ9H2I8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRMDAQ9H2I8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRMDAQ9H2I8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRMDAQ9H2I8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRMDAQ9H2I8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRMDAQ9H2I8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRMDAQ9H2I8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRMDAQ9H2I8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRMDAQ9H2I8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRMDAQ9H2I8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRMDAQ9H2I8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRMDAQ9H2I8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRMDAQ9H2I8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRMDAQ9H2I8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRMDAQ9H2I8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.4 ms