Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BHLHE41Q9C0J9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BHLHE41Q9C0J9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
BHLHE41Q9C0J9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
BHLHE41Q9C0J9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BHLHE41Q9C0J9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BHLHE41Q9C0J9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BHLHE41Q9C0J9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
BHLHE41Q9C0J9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BHLHE41Q9C0J9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BHLHE41Q9C0J9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BHLHE41Q9C0J9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BHLHE41Q9C0J9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
BHLHE41Q9C0J9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BHLHE41Q9C0J9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BHLHE41Q9C0J9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BHLHE41Q9C0J9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BHLHE41Q9C0J9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BHLHE41Q9C0J9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BHLHE41Q9C0J9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BHLHE41Q9C0J9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BHLHE41Q9C0J9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BHLHE41Q9C0J9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
BHLHE41Q9C0J9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
BHLHE41Q9C0J9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
BHLHE41Q9C0J9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BHLHE41Q9C0J9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BHLHE41Q9C0J9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BHLHE41Q9C0J9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BHLHE41Q9C0J9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BHLHE41Q9C0J9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BHLHE41Q9C0J9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BHLHE41Q9C0J9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BHLHE41Q9C0J9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BHLHE41Q9C0J9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
BHLHE41Q9C0J9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BHLHE41Q9C0J9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BHLHE41Q9C0J9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BHLHE41Q9C0J9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BHLHE41Q9C0J9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BHLHE41Q9C0J9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BHLHE41Q9C0J9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BHLHE41Q9C0J9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BHLHE41Q9C0J9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BHLHE41Q9C0J9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BHLHE41Q9C0J9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BHLHE41Q9C0J9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BHLHE41Q9C0J9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BHLHE41Q9C0J9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BHLHE41Q9C0J9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BHLHE41Q9C0J9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BHLHE41Q9C0J9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BHLHE41Q9C0J9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BHLHE41Q9C0J9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
BHLHE41Q9C0J9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BHLHE41Q9C0J9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BHLHE41Q9C0J9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BHLHE41Q9C0J9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BHLHE41Q9C0J9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BHLHE41Q9C0J9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BHLHE41Q9C0J9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
BHLHE41Q9C0J9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BHLHE41Q9C0J9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BHLHE41Q9C0J9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BHLHE41Q9C0J9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BHLHE41Q9C0J9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BHLHE41Q9C0J9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BHLHE41Q9C0J9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BHLHE41Q9C0J9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BHLHE41Q9C0J9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BHLHE41Q9C0J9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BHLHE41Q9C0J9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BHLHE41Q9C0J9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BHLHE41Q9C0J9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BHLHE41Q9C0J9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BHLHE41Q9C0J9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BHLHE41Q9C0J9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BHLHE41Q9C0J9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BHLHE41Q9C0J9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BHLHE41Q9C0J9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BHLHE41Q9C0J9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BHLHE41Q9C0J9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BHLHE41Q9C0J9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BHLHE41Q9C0J9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BHLHE41Q9C0J9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BHLHE41Q9C0J9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BHLHE41Q9C0J9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BHLHE41Q9C0J9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BHLHE41Q9C0J9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BHLHE41Q9C0J9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BHLHE41Q9C0J9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BHLHE41Q9C0J9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BHLHE41Q9C0J9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BHLHE41Q9C0J9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BHLHE41Q9C0J9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BHLHE41Q9C0J9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BHLHE41Q9C0J9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BHLHE41Q9C0J9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BHLHE41Q9C0J9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BHLHE41Q9C0J9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms