Protein–RNA interactions for Protein: Q96HF1

SFRP2, Secreted frizzled-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP2Q96HF1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SFRP2Q96HF1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SFRP2Q96HF1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SFRP2Q96HF1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SFRP2Q96HF1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SFRP2Q96HF1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SFRP2Q96HF1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFRP2Q96HF1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFRP2Q96HF1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFRP2Q96HF1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFRP2Q96HF1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFRP2Q96HF1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFRP2Q96HF1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFRP2Q96HF1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFRP2Q96HF1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFRP2Q96HF1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFRP2Q96HF1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFRP2Q96HF1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFRP2Q96HF1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SFRP2Q96HF1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFRP2Q96HF1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFRP2Q96HF1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SFRP2Q96HF1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFRP2Q96HF1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFRP2Q96HF1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFRP2Q96HF1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFRP2Q96HF1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFRP2Q96HF1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFRP2Q96HF1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFRP2Q96HF1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFRP2Q96HF1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFRP2Q96HF1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFRP2Q96HF1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFRP2Q96HF1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFRP2Q96HF1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFRP2Q96HF1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFRP2Q96HF1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFRP2Q96HF1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFRP2Q96HF1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFRP2Q96HF1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFRP2Q96HF1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SFRP2Q96HF1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
SFRP2Q96HF1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SFRP2Q96HF1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFRP2Q96HF1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFRP2Q96HF1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFRP2Q96HF1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFRP2Q96HF1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFRP2Q96HF1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFRP2Q96HF1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFRP2Q96HF1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFRP2Q96HF1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFRP2Q96HF1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFRP2Q96HF1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFRP2Q96HF1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFRP2Q96HF1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFRP2Q96HF1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFRP2Q96HF1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFRP2Q96HF1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFRP2Q96HF1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFRP2Q96HF1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFRP2Q96HF1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SFRP2Q96HF1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFRP2Q96HF1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFRP2Q96HF1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFRP2Q96HF1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SFRP2Q96HF1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFRP2Q96HF1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFRP2Q96HF1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFRP2Q96HF1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFRP2Q96HF1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFRP2Q96HF1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFRP2Q96HF1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFRP2Q96HF1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFRP2Q96HF1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFRP2Q96HF1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFRP2Q96HF1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFRP2Q96HF1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFRP2Q96HF1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFRP2Q96HF1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFRP2Q96HF1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFRP2Q96HF1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFRP2Q96HF1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFRP2Q96HF1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFRP2Q96HF1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFRP2Q96HF1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFRP2Q96HF1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SFRP2Q96HF1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
SFRP2Q96HF1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFRP2Q96HF1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFRP2Q96HF1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFRP2Q96HF1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFRP2Q96HF1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFRP2Q96HF1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFRP2Q96HF1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFRP2Q96HF1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFRP2Q96HF1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFRP2Q96HF1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFRP2Q96HF1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFRP2Q96HF1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms