Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SIRT1Q96EB6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SIRT1Q96EB6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SIRT1Q96EB6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
SIRT1Q96EB6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SIRT1Q96EB6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SIRT1Q96EB6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
SIRT1Q96EB6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
SIRT1Q96EB6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SIRT1Q96EB6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SIRT1Q96EB6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SIRT1Q96EB6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SIRT1Q96EB6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
SIRT1Q96EB6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
SIRT1Q96EB6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SIRT1Q96EB6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SIRT1Q96EB6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
SIRT1Q96EB6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
SIRT1Q96EB6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
SIRT1Q96EB6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
SIRT1Q96EB6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
SIRT1Q96EB6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
SIRT1Q96EB6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SIRT1Q96EB6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SIRT1Q96EB6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SIRT1Q96EB6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
SIRT1Q96EB6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
SIRT1Q96EB6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
SIRT1Q96EB6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
SIRT1Q96EB6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
SIRT1Q96EB6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SIRT1Q96EB6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
SIRT1Q96EB6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SIRT1Q96EB6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SIRT1Q96EB6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SIRT1Q96EB6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SIRT1Q96EB6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SIRT1Q96EB6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SIRT1Q96EB6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SIRT1Q96EB6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SIRT1Q96EB6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SIRT1Q96EB6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SIRT1Q96EB6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SIRT1Q96EB6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SIRT1Q96EB6 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SIRT1Q96EB6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SIRT1Q96EB6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
SIRT1Q96EB6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
SIRT1Q96EB6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SIRT1Q96EB6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SIRT1Q96EB6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
SIRT1Q96EB6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SIRT1Q96EB6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
SIRT1Q96EB6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
SIRT1Q96EB6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
SIRT1Q96EB6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
SIRT1Q96EB6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
SIRT1Q96EB6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SIRT1Q96EB6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SIRT1Q96EB6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SIRT1Q96EB6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SIRT1Q96EB6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SIRT1Q96EB6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
SIRT1Q96EB6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
SIRT1Q96EB6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
SIRT1Q96EB6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
SIRT1Q96EB6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
SIRT1Q96EB6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
SIRT1Q96EB6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
SIRT1Q96EB6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
SIRT1Q96EB6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
SIRT1Q96EB6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SIRT1Q96EB6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SIRT1Q96EB6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
SIRT1Q96EB6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
SIRT1Q96EB6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
SIRT1Q96EB6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
SIRT1Q96EB6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
SIRT1Q96EB6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SIRT1Q96EB6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SIRT1Q96EB6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SIRT1Q96EB6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SIRT1Q96EB6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SIRT1Q96EB6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SIRT1Q96EB6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SIRT1Q96EB6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SIRT1Q96EB6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SIRT1Q96EB6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SIRT1Q96EB6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
SIRT1Q96EB6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
SIRT1Q96EB6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
SIRT1Q96EB6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SIRT1Q96EB6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SIRT1Q96EB6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SIRT1Q96EB6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SIRT1Q96EB6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SIRT1Q96EB6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SIRT1Q96EB6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SIRT1Q96EB6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SIRT1Q96EB6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms