Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUQ7

CACTIN, Cactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACTINQ8WUQ7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CACTINQ8WUQ7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CACTINQ8WUQ7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CACTINQ8WUQ7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CACTINQ8WUQ7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CACTINQ8WUQ7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CACTINQ8WUQ7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CACTINQ8WUQ7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CACTINQ8WUQ7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CACTINQ8WUQ7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CACTINQ8WUQ7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CACTINQ8WUQ7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CACTINQ8WUQ7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CACTINQ8WUQ7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CACTINQ8WUQ7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CACTINQ8WUQ7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CACTINQ8WUQ7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CACTINQ8WUQ7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CACTINQ8WUQ7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CACTINQ8WUQ7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CACTINQ8WUQ7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CACTINQ8WUQ7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CACTINQ8WUQ7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CACTINQ8WUQ7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CACTINQ8WUQ7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CACTINQ8WUQ7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CACTINQ8WUQ7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CACTINQ8WUQ7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CACTINQ8WUQ7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CACTINQ8WUQ7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CACTINQ8WUQ7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CACTINQ8WUQ7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CACTINQ8WUQ7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CACTINQ8WUQ7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CACTINQ8WUQ7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CACTINQ8WUQ7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CACTINQ8WUQ7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CACTINQ8WUQ7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CACTINQ8WUQ7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CACTINQ8WUQ7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CACTINQ8WUQ7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CACTINQ8WUQ7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CACTINQ8WUQ7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CACTINQ8WUQ7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CACTINQ8WUQ7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CACTINQ8WUQ7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CACTINQ8WUQ7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CACTINQ8WUQ7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CACTINQ8WUQ7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CACTINQ8WUQ7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CACTINQ8WUQ7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CACTINQ8WUQ7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CACTINQ8WUQ7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CACTINQ8WUQ7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CACTINQ8WUQ7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CACTINQ8WUQ7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CACTINQ8WUQ7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CACTINQ8WUQ7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CACTINQ8WUQ7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CACTINQ8WUQ7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CACTINQ8WUQ7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CACTINQ8WUQ7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CACTINQ8WUQ7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CACTINQ8WUQ7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CACTINQ8WUQ7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CACTINQ8WUQ7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CACTINQ8WUQ7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CACTINQ8WUQ7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CACTINQ8WUQ7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CACTINQ8WUQ7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CACTINQ8WUQ7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CACTINQ8WUQ7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CACTINQ8WUQ7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CACTINQ8WUQ7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CACTINQ8WUQ7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CACTINQ8WUQ7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CACTINQ8WUQ7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CACTINQ8WUQ7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CACTINQ8WUQ7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CACTINQ8WUQ7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CACTINQ8WUQ7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CACTINQ8WUQ7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CACTINQ8WUQ7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CACTINQ8WUQ7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CACTINQ8WUQ7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CACTINQ8WUQ7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CACTINQ8WUQ7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CACTINQ8WUQ7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CACTINQ8WUQ7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CACTINQ8WUQ7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CACTINQ8WUQ7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CACTINQ8WUQ7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CACTINQ8WUQ7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CACTINQ8WUQ7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CACTINQ8WUQ7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CACTINQ8WUQ7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CACTINQ8WUQ7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CACTINQ8WUQ7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CACTINQ8WUQ7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CACTINQ8WUQ7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101 ms