Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHLHE23Q8NDY6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHLHE23Q8NDY6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHLHE23Q8NDY6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHLHE23Q8NDY6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHLHE23Q8NDY6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHLHE23Q8NDY6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHLHE23Q8NDY6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHLHE23Q8NDY6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHLHE23Q8NDY6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHLHE23Q8NDY6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHLHE23Q8NDY6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHLHE23Q8NDY6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHLHE23Q8NDY6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BHLHE23Q8NDY6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
BHLHE23Q8NDY6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BHLHE23Q8NDY6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
BHLHE23Q8NDY6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BHLHE23Q8NDY6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BHLHE23Q8NDY6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BHLHE23Q8NDY6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BHLHE23Q8NDY6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
BHLHE23Q8NDY6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BHLHE23Q8NDY6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BHLHE23Q8NDY6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BHLHE23Q8NDY6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BHLHE23Q8NDY6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BHLHE23Q8NDY6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BHLHE23Q8NDY6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BHLHE23Q8NDY6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BHLHE23Q8NDY6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BHLHE23Q8NDY6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BHLHE23Q8NDY6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BHLHE23Q8NDY6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BHLHE23Q8NDY6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BHLHE23Q8NDY6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BHLHE23Q8NDY6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BHLHE23Q8NDY6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BHLHE23Q8NDY6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BHLHE23Q8NDY6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BHLHE23Q8NDY6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BHLHE23Q8NDY6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BHLHE23Q8NDY6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BHLHE23Q8NDY6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BHLHE23Q8NDY6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BHLHE23Q8NDY6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BHLHE23Q8NDY6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BHLHE23Q8NDY6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BHLHE23Q8NDY6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BHLHE23Q8NDY6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BHLHE23Q8NDY6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BHLHE23Q8NDY6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BHLHE23Q8NDY6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BHLHE23Q8NDY6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BHLHE23Q8NDY6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BHLHE23Q8NDY6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
BHLHE23Q8NDY6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
BHLHE23Q8NDY6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
BHLHE23Q8NDY6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BHLHE23Q8NDY6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BHLHE23Q8NDY6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BHLHE23Q8NDY6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BHLHE23Q8NDY6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BHLHE23Q8NDY6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
BHLHE23Q8NDY6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHLHE23Q8NDY6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHLHE23Q8NDY6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHLHE23Q8NDY6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHLHE23Q8NDY6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BHLHE23Q8NDY6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BHLHE23Q8NDY6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BHLHE23Q8NDY6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BHLHE23Q8NDY6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHLHE23Q8NDY6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHLHE23Q8NDY6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHLHE23Q8NDY6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHLHE23Q8NDY6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHLHE23Q8NDY6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHLHE23Q8NDY6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHLHE23Q8NDY6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHLHE23Q8NDY6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BHLHE23Q8NDY6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BHLHE23Q8NDY6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BHLHE23Q8NDY6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BHLHE23Q8NDY6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BHLHE23Q8NDY6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BHLHE23Q8NDY6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BHLHE23Q8NDY6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BHLHE23Q8NDY6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
BHLHE23Q8NDY6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BHLHE23Q8NDY6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BHLHE23Q8NDY6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BHLHE23Q8NDY6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BHLHE23Q8NDY6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BHLHE23Q8NDY6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BHLHE23Q8NDY6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BHLHE23Q8NDY6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BHLHE23Q8NDY6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BHLHE23Q8NDY6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BHLHE23Q8NDY6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms