Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVT5

KSR1, Kinase suppressor of Ras 1, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KSR1Q8IVT5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KSR1Q8IVT5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KSR1Q8IVT5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KSR1Q8IVT5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
KSR1Q8IVT5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KSR1Q8IVT5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KSR1Q8IVT5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KSR1Q8IVT5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KSR1Q8IVT5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KSR1Q8IVT5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KSR1Q8IVT5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KSR1Q8IVT5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KSR1Q8IVT5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KSR1Q8IVT5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KSR1Q8IVT5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KSR1Q8IVT5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KSR1Q8IVT5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KSR1Q8IVT5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KSR1Q8IVT5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KSR1Q8IVT5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
KSR1Q8IVT5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KSR1Q8IVT5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KSR1Q8IVT5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KSR1Q8IVT5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KSR1Q8IVT5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KSR1Q8IVT5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KSR1Q8IVT5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KSR1Q8IVT5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KSR1Q8IVT5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
KSR1Q8IVT5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
KSR1Q8IVT5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
KSR1Q8IVT5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KSR1Q8IVT5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KSR1Q8IVT5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KSR1Q8IVT5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KSR1Q8IVT5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KSR1Q8IVT5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KSR1Q8IVT5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
KSR1Q8IVT5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KSR1Q8IVT5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KSR1Q8IVT5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KSR1Q8IVT5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KSR1Q8IVT5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KSR1Q8IVT5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KSR1Q8IVT5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KSR1Q8IVT5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KSR1Q8IVT5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KSR1Q8IVT5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KSR1Q8IVT5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KSR1Q8IVT5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KSR1Q8IVT5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KSR1Q8IVT5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
KSR1Q8IVT5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KSR1Q8IVT5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KSR1Q8IVT5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KSR1Q8IVT5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KSR1Q8IVT5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KSR1Q8IVT5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KSR1Q8IVT5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KSR1Q8IVT5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KSR1Q8IVT5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KSR1Q8IVT5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KSR1Q8IVT5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
KSR1Q8IVT5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KSR1Q8IVT5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KSR1Q8IVT5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KSR1Q8IVT5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KSR1Q8IVT5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KSR1Q8IVT5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KSR1Q8IVT5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KSR1Q8IVT5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KSR1Q8IVT5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KSR1Q8IVT5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
KSR1Q8IVT5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KSR1Q8IVT5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KSR1Q8IVT5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KSR1Q8IVT5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KSR1Q8IVT5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KSR1Q8IVT5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KSR1Q8IVT5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KSR1Q8IVT5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KSR1Q8IVT5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KSR1Q8IVT5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KSR1Q8IVT5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KSR1Q8IVT5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KSR1Q8IVT5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KSR1Q8IVT5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KSR1Q8IVT5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KSR1Q8IVT5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KSR1Q8IVT5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KSR1Q8IVT5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KSR1Q8IVT5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KSR1Q8IVT5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KSR1Q8IVT5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
KSR1Q8IVT5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KSR1Q8IVT5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KSR1Q8IVT5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KSR1Q8IVT5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KSR1Q8IVT5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KSR1Q8IVT5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms