Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMN6

CAPRIN2, Caprin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN2Q6IMN6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPRIN2Q6IMN6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPRIN2Q6IMN6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPRIN2Q6IMN6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CAPRIN2Q6IMN6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAPRIN2Q6IMN6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPRIN2Q6IMN6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPRIN2Q6IMN6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPRIN2Q6IMN6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPRIN2Q6IMN6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPRIN2Q6IMN6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPRIN2Q6IMN6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPRIN2Q6IMN6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPRIN2Q6IMN6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPRIN2Q6IMN6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPRIN2Q6IMN6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPRIN2Q6IMN6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPRIN2Q6IMN6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPRIN2Q6IMN6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPRIN2Q6IMN6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPRIN2Q6IMN6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPRIN2Q6IMN6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPRIN2Q6IMN6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPRIN2Q6IMN6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPRIN2Q6IMN6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPRIN2Q6IMN6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPRIN2Q6IMN6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPRIN2Q6IMN6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPRIN2Q6IMN6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPRIN2Q6IMN6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPRIN2Q6IMN6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPRIN2Q6IMN6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPRIN2Q6IMN6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPRIN2Q6IMN6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPRIN2Q6IMN6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPRIN2Q6IMN6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPRIN2Q6IMN6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPRIN2Q6IMN6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPRIN2Q6IMN6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPRIN2Q6IMN6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPRIN2Q6IMN6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPRIN2Q6IMN6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPRIN2Q6IMN6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPRIN2Q6IMN6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPRIN2Q6IMN6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPRIN2Q6IMN6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CAPRIN2Q6IMN6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPRIN2Q6IMN6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPRIN2Q6IMN6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPRIN2Q6IMN6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPRIN2Q6IMN6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPRIN2Q6IMN6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPRIN2Q6IMN6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPRIN2Q6IMN6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPRIN2Q6IMN6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPRIN2Q6IMN6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPRIN2Q6IMN6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPRIN2Q6IMN6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPRIN2Q6IMN6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPRIN2Q6IMN6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPRIN2Q6IMN6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPRIN2Q6IMN6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPRIN2Q6IMN6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPRIN2Q6IMN6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPRIN2Q6IMN6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPRIN2Q6IMN6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPRIN2Q6IMN6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPRIN2Q6IMN6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPRIN2Q6IMN6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPRIN2Q6IMN6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPRIN2Q6IMN6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPRIN2Q6IMN6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPRIN2Q6IMN6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPRIN2Q6IMN6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPRIN2Q6IMN6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPRIN2Q6IMN6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPRIN2Q6IMN6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPRIN2Q6IMN6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPRIN2Q6IMN6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPRIN2Q6IMN6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPRIN2Q6IMN6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPRIN2Q6IMN6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPRIN2Q6IMN6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPRIN2Q6IMN6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPRIN2Q6IMN6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPRIN2Q6IMN6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPRIN2Q6IMN6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPRIN2Q6IMN6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPRIN2Q6IMN6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPRIN2Q6IMN6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPRIN2Q6IMN6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPRIN2Q6IMN6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPRIN2Q6IMN6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPRIN2Q6IMN6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPRIN2Q6IMN6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPRIN2Q6IMN6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPRIN2Q6IMN6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPRIN2Q6IMN6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPRIN2Q6IMN6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms