Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX6

SLC45A4, Solute carrier family 45 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC45A4Q5BKX6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC45A4Q5BKX6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC45A4Q5BKX6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC45A4Q5BKX6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC45A4Q5BKX6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC45A4Q5BKX6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC45A4Q5BKX6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC45A4Q5BKX6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC45A4Q5BKX6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC45A4Q5BKX6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC45A4Q5BKX6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC45A4Q5BKX6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC45A4Q5BKX6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC45A4Q5BKX6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC45A4Q5BKX6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC45A4Q5BKX6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC45A4Q5BKX6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC45A4Q5BKX6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC45A4Q5BKX6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC45A4Q5BKX6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC45A4Q5BKX6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC45A4Q5BKX6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC45A4Q5BKX6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC45A4Q5BKX6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC45A4Q5BKX6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC45A4Q5BKX6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC45A4Q5BKX6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC45A4Q5BKX6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC45A4Q5BKX6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC45A4Q5BKX6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC45A4Q5BKX6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC45A4Q5BKX6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC45A4Q5BKX6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC45A4Q5BKX6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC45A4Q5BKX6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC45A4Q5BKX6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC45A4Q5BKX6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC45A4Q5BKX6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC45A4Q5BKX6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC45A4Q5BKX6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC45A4Q5BKX6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC45A4Q5BKX6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC45A4Q5BKX6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC45A4Q5BKX6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC45A4Q5BKX6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC45A4Q5BKX6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC45A4Q5BKX6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC45A4Q5BKX6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC45A4Q5BKX6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC45A4Q5BKX6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC45A4Q5BKX6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC45A4Q5BKX6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC45A4Q5BKX6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC45A4Q5BKX6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC45A4Q5BKX6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC45A4Q5BKX6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC45A4Q5BKX6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC45A4Q5BKX6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC45A4Q5BKX6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC45A4Q5BKX6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC45A4Q5BKX6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC45A4Q5BKX6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC45A4Q5BKX6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC45A4Q5BKX6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC45A4Q5BKX6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC45A4Q5BKX6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC45A4Q5BKX6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC45A4Q5BKX6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC45A4Q5BKX6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC45A4Q5BKX6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC45A4Q5BKX6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC45A4Q5BKX6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC45A4Q5BKX6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC45A4Q5BKX6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC45A4Q5BKX6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC45A4Q5BKX6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC45A4Q5BKX6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC45A4Q5BKX6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC45A4Q5BKX6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC45A4Q5BKX6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC45A4Q5BKX6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC45A4Q5BKX6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC45A4Q5BKX6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC45A4Q5BKX6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC45A4Q5BKX6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC45A4Q5BKX6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC45A4Q5BKX6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC45A4Q5BKX6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC45A4Q5BKX6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC45A4Q5BKX6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC45A4Q5BKX6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC45A4Q5BKX6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC45A4Q5BKX6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC45A4Q5BKX6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC45A4Q5BKX6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC45A4Q5BKX6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC45A4Q5BKX6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC45A4Q5BKX6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC45A4Q5BKX6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC45A4Q5BKX6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms