Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CUL3Q13618 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CUL3Q13618 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CUL3Q13618 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CUL3Q13618 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CUL3Q13618 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CUL3Q13618 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CUL3Q13618 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CUL3Q13618 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CUL3Q13618 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CUL3Q13618 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CUL3Q13618 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CUL3Q13618 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CUL3Q13618 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CUL3Q13618 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CUL3Q13618 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CUL3Q13618 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CUL3Q13618 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CUL3Q13618 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CUL3Q13618 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CUL3Q13618 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CUL3Q13618 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CUL3Q13618 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CUL3Q13618 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CUL3Q13618 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CUL3Q13618 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CUL3Q13618 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CUL3Q13618 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CUL3Q13618 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CUL3Q13618 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CUL3Q13618 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CUL3Q13618 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CUL3Q13618 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CUL3Q13618 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CUL3Q13618 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CUL3Q13618 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CUL3Q13618 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CUL3Q13618 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CUL3Q13618 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CUL3Q13618 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CUL3Q13618 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CUL3Q13618 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CUL3Q13618 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CUL3Q13618 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CUL3Q13618 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CUL3Q13618 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CUL3Q13618 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CUL3Q13618 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CUL3Q13618 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CUL3Q13618 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CUL3Q13618 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CUL3Q13618 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CUL3Q13618 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CUL3Q13618 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CUL3Q13618 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CUL3Q13618 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CUL3Q13618 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CUL3Q13618 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CUL3Q13618 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CUL3Q13618 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CUL3Q13618 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CUL3Q13618 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CUL3Q13618 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CUL3Q13618 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CUL3Q13618 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CUL3Q13618 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CUL3Q13618 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CUL3Q13618 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CUL3Q13618 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CUL3Q13618 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CUL3Q13618 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CUL3Q13618 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CUL3Q13618 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CUL3Q13618 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CUL3Q13618 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CUL3Q13618 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CUL3Q13618 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CUL3Q13618 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CUL3Q13618 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CUL3Q13618 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CUL3Q13618 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CUL3Q13618 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CUL3Q13618 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CUL3Q13618 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CUL3Q13618 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CUL3Q13618 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CUL3Q13618 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CUL3Q13618 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CUL3Q13618 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CUL3Q13618 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CUL3Q13618 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CUL3Q13618 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CUL3Q13618 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CUL3Q13618 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CUL3Q13618 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CUL3Q13618 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CUL3Q13618 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CUL3Q13618 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CUL3Q13618 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CUL3Q13618 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
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