Protein–RNA interactions for Protein: P47869

GABRA2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA2P47869 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GABRA2P47869 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GABRA2P47869 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GABRA2P47869 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GABRA2P47869 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GABRA2P47869 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GABRA2P47869 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GABRA2P47869 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GABRA2P47869 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GABRA2P47869 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GABRA2P47869 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GABRA2P47869 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GABRA2P47869 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GABRA2P47869 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABRA2P47869 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABRA2P47869 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GABRA2P47869 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABRA2P47869 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABRA2P47869 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABRA2P47869 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABRA2P47869 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABRA2P47869 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABRA2P47869 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABRA2P47869 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABRA2P47869 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABRA2P47869 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABRA2P47869 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABRA2P47869 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABRA2P47869 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABRA2P47869 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABRA2P47869 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABRA2P47869 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABRA2P47869 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABRA2P47869 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABRA2P47869 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABRA2P47869 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRA2P47869 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRA2P47869 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRA2P47869 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRA2P47869 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRA2P47869 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRA2P47869 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRA2P47869 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRA2P47869 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRA2P47869 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRA2P47869 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRA2P47869 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRA2P47869 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRA2P47869 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRA2P47869 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRA2P47869 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRA2P47869 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRA2P47869 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRA2P47869 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRA2P47869 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRA2P47869 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRA2P47869 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRA2P47869 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRA2P47869 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRA2P47869 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRA2P47869 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRA2P47869 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRA2P47869 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRA2P47869 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRA2P47869 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRA2P47869 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRA2P47869 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRA2P47869 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRA2P47869 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRA2P47869 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRA2P47869 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRA2P47869 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRA2P47869 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRA2P47869 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRA2P47869 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRA2P47869 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABRA2P47869 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GABRA2P47869 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABRA2P47869 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABRA2P47869 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRA2P47869 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRA2P47869 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRA2P47869 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRA2P47869 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRA2P47869 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRA2P47869 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRA2P47869 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABRA2P47869 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABRA2P47869 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABRA2P47869 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABRA2P47869 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABRA2P47869 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABRA2P47869 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABRA2P47869 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABRA2P47869 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABRA2P47869 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABRA2P47869 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABRA2P47869 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABRA2P47869 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABRA2P47869 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms