Protein–RNA interactions for Protein: P46092

CCR10, C-C chemokine receptor type 10, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR10P46092 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCR10P46092 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCR10P46092 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCR10P46092 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCR10P46092 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCR10P46092 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCR10P46092 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCR10P46092 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCR10P46092 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCR10P46092 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCR10P46092 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCR10P46092 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCR10P46092 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCR10P46092 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCR10P46092 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCR10P46092 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCR10P46092 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCR10P46092 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCR10P46092 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCR10P46092 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCR10P46092 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCR10P46092 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCR10P46092 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCR10P46092 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCR10P46092 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCR10P46092 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCR10P46092 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCR10P46092 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCR10P46092 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCR10P46092 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCR10P46092 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCR10P46092 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCR10P46092 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCR10P46092 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCR10P46092 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCR10P46092 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCR10P46092 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCR10P46092 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCR10P46092 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCR10P46092 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCR10P46092 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCR10P46092 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCR10P46092 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCR10P46092 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCR10P46092 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCR10P46092 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCR10P46092 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCR10P46092 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCR10P46092 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCR10P46092 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCR10P46092 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCR10P46092 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCR10P46092 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCR10P46092 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCR10P46092 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCR10P46092 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCR10P46092 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCR10P46092 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCR10P46092 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCR10P46092 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCR10P46092 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCR10P46092 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCR10P46092 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCR10P46092 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCR10P46092 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCR10P46092 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCR10P46092 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCR10P46092 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCR10P46092 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCR10P46092 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCR10P46092 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCR10P46092 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCR10P46092 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCR10P46092 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCR10P46092 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCR10P46092 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCR10P46092 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCR10P46092 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCR10P46092 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCR10P46092 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCR10P46092 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCR10P46092 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCR10P46092 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCR10P46092 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCR10P46092 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCR10P46092 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCR10P46092 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCR10P46092 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCR10P46092 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCR10P46092 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCR10P46092 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCR10P46092 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCR10P46092 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCR10P46092 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCR10P46092 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCR10P46092 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCR10P46092 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCR10P46092 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCR10P46092 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCR10P46092 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.9 ms