Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPA3P35244 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPA3P35244 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPA3P35244 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPA3P35244 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPA3P35244 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RPA3P35244 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RPA3P35244 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPA3P35244 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPA3P35244 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPA3P35244 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPA3P35244 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPA3P35244 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPA3P35244 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPA3P35244 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPA3P35244 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPA3P35244 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPA3P35244 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RPA3P35244 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPA3P35244 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPA3P35244 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPA3P35244 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPA3P35244 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPA3P35244 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPA3P35244 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPA3P35244 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPA3P35244 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RPA3P35244 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPA3P35244 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPA3P35244 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPA3P35244 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPA3P35244 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPA3P35244 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPA3P35244 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPA3P35244 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPA3P35244 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPA3P35244 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPA3P35244 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPA3P35244 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPA3P35244 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RPA3P35244 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPA3P35244 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPA3P35244 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPA3P35244 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPA3P35244 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPA3P35244 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RPA3P35244 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPA3P35244 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPA3P35244 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPA3P35244 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPA3P35244 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPA3P35244 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPA3P35244 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPA3P35244 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPA3P35244 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPA3P35244 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPA3P35244 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPA3P35244 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPA3P35244 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPA3P35244 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPA3P35244 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPA3P35244 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPA3P35244 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPA3P35244 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPA3P35244 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RPA3P35244 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPA3P35244 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPA3P35244 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPA3P35244 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RPA3P35244 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RPA3P35244 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPA3P35244 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPA3P35244 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPA3P35244 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPA3P35244 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPA3P35244 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPA3P35244 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPA3P35244 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPA3P35244 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RPA3P35244 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPA3P35244 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPA3P35244 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPA3P35244 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPA3P35244 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPA3P35244 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPA3P35244 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPA3P35244 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RPA3P35244 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPA3P35244 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPA3P35244 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPA3P35244 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPA3P35244 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPA3P35244 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPA3P35244 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPA3P35244 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPA3P35244 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPA3P35244 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPA3P35244 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPA3P35244 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPA3P35244 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.7 ms