Protein–RNA interactions for Protein: P35240

NF2, Merlin, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF2P35240 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
NF2P35240 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NF2P35240 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NF2P35240 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NF2P35240 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NF2P35240 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NF2P35240 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NF2P35240 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NF2P35240 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NF2P35240 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NF2P35240 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NF2P35240 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NF2P35240 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NF2P35240 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NF2P35240 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
NF2P35240 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NF2P35240 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NF2P35240 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NF2P35240 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NF2P35240 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NF2P35240 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NF2P35240 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NF2P35240 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NF2P35240 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NF2P35240 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NF2P35240 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NF2P35240 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
NF2P35240 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NF2P35240 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NF2P35240 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
NF2P35240 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NF2P35240 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NF2P35240 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
NF2P35240 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NF2P35240 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NF2P35240 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NF2P35240 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NF2P35240 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NF2P35240 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NF2P35240 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NF2P35240 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NF2P35240 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NF2P35240 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NF2P35240 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NF2P35240 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
NF2P35240 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NF2P35240 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NF2P35240 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
NF2P35240 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NF2P35240 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NF2P35240 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NF2P35240 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NF2P35240 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NF2P35240 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NF2P35240 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29■■■□□ 2.23
NF2P35240 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NF2P35240 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NF2P35240 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NF2P35240 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NF2P35240 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NF2P35240 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NF2P35240 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NF2P35240 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NF2P35240 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NF2P35240 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NF2P35240 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NF2P35240 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NF2P35240 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NF2P35240 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NF2P35240 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NF2P35240 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NF2P35240 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NF2P35240 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NF2P35240 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NF2P35240 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NF2P35240 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NF2P35240 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NF2P35240 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NF2P35240 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NF2P35240 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NF2P35240 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NF2P35240 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NF2P35240 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NF2P35240 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NF2P35240 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NF2P35240 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NF2P35240 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
NF2P35240 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NF2P35240 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NF2P35240 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NF2P35240 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NF2P35240 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NF2P35240 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NF2P35240 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NF2P35240 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NF2P35240 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
NF2P35240 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NF2P35240 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NF2P35240 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NF2P35240 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms