Protein–RNA interactions for Protein: P23368

ME2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME2P23368 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ME2P23368 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ME2P23368 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ME2P23368 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ME2P23368 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ME2P23368 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ME2P23368 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ME2P23368 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ME2P23368 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ME2P23368 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ME2P23368 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ME2P23368 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ME2P23368 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ME2P23368 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ME2P23368 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ME2P23368 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ME2P23368 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ME2P23368 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ME2P23368 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ME2P23368 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ME2P23368 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ME2P23368 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ME2P23368 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ME2P23368 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ME2P23368 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ME2P23368 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ME2P23368 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ME2P23368 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ME2P23368 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ME2P23368 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ME2P23368 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ME2P23368 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ME2P23368 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ME2P23368 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ME2P23368 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ME2P23368 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ME2P23368 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ME2P23368 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ME2P23368 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ME2P23368 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ME2P23368 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ME2P23368 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ME2P23368 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ME2P23368 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ME2P23368 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ME2P23368 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ME2P23368 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ME2P23368 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ME2P23368 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ME2P23368 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ME2P23368 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ME2P23368 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ME2P23368 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ME2P23368 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ME2P23368 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ME2P23368 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ME2P23368 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ME2P23368 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ME2P23368 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ME2P23368 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ME2P23368 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ME2P23368 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ME2P23368 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ME2P23368 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ME2P23368 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ME2P23368 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ME2P23368 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ME2P23368 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ME2P23368 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ME2P23368 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ME2P23368 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ME2P23368 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ME2P23368 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ME2P23368 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ME2P23368 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ME2P23368 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ME2P23368 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ME2P23368 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ME2P23368 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ME2P23368 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ME2P23368 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ME2P23368 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ME2P23368 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ME2P23368 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ME2P23368 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ME2P23368 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ME2P23368 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ME2P23368 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ME2P23368 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ME2P23368 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ME2P23368 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ME2P23368 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ME2P23368 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ME2P23368 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ME2P23368 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ME2P23368 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ME2P23368 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ME2P23368 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ME2P23368 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ME2P23368 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms