Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EPHA1P21709 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EPHA1P21709 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
EPHA1P21709 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EPHA1P21709 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EPHA1P21709 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EPHA1P21709 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EPHA1P21709 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EPHA1P21709 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EPHA1P21709 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
EPHA1P21709 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EPHA1P21709 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EPHA1P21709 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EPHA1P21709 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EPHA1P21709 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EPHA1P21709 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EPHA1P21709 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EPHA1P21709 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EPHA1P21709 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
EPHA1P21709 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EPHA1P21709 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EPHA1P21709 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EPHA1P21709 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
EPHA1P21709 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
EPHA1P21709 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EPHA1P21709 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EPHA1P21709 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EPHA1P21709 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EPHA1P21709 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EPHA1P21709 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EPHA1P21709 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EPHA1P21709 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
EPHA1P21709 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EPHA1P21709 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EPHA1P21709 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EPHA1P21709 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EPHA1P21709 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EPHA1P21709 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EPHA1P21709 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EPHA1P21709 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EPHA1P21709 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EPHA1P21709 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EPHA1P21709 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EPHA1P21709 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EPHA1P21709 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EPHA1P21709 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EPHA1P21709 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EPHA1P21709 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EPHA1P21709 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EPHA1P21709 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EPHA1P21709 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
EPHA1P21709 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EPHA1P21709 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EPHA1P21709 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EPHA1P21709 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EPHA1P21709 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EPHA1P21709 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EPHA1P21709 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EPHA1P21709 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EPHA1P21709 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EPHA1P21709 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EPHA1P21709 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EPHA1P21709 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EPHA1P21709 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EPHA1P21709 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
EPHA1P21709 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EPHA1P21709 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EPHA1P21709 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EPHA1P21709 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
EPHA1P21709 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EPHA1P21709 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EPHA1P21709 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EPHA1P21709 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EPHA1P21709 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EPHA1P21709 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPHA1P21709 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPHA1P21709 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPHA1P21709 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPHA1P21709 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
EPHA1P21709 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPHA1P21709 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPHA1P21709 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPHA1P21709 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPHA1P21709 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPHA1P21709 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPHA1P21709 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPHA1P21709 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPHA1P21709 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EPHA1P21709 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EPHA1P21709 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EPHA1P21709 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
EPHA1P21709 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
EPHA1P21709 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EPHA1P21709 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EPHA1P21709 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EPHA1P21709 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EPHA1P21709 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EPHA1P21709 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EPHA1P21709 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EPHA1P21709 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms