Protein–RNA interactions for Protein: P20142

PGC, Gastricsin, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGCP20142 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGCP20142 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGCP20142 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGCP20142 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGCP20142 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGCP20142 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGCP20142 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGCP20142 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGCP20142 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGCP20142 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGCP20142 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGCP20142 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGCP20142 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGCP20142 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGCP20142 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PGCP20142 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGCP20142 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PGCP20142 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGCP20142 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGCP20142 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGCP20142 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGCP20142 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGCP20142 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGCP20142 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGCP20142 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGCP20142 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGCP20142 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGCP20142 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGCP20142 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGCP20142 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGCP20142 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGCP20142 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PGCP20142 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGCP20142 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGCP20142 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGCP20142 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGCP20142 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PGCP20142 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGCP20142 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGCP20142 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PGCP20142 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGCP20142 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGCP20142 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PGCP20142 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGCP20142 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGCP20142 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGCP20142 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PGCP20142 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGCP20142 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGCP20142 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGCP20142 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGCP20142 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGCP20142 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGCP20142 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGCP20142 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGCP20142 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGCP20142 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PGCP20142 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGCP20142 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGCP20142 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGCP20142 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PGCP20142 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGCP20142 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGCP20142 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGCP20142 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGCP20142 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGCP20142 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGCP20142 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGCP20142 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGCP20142 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGCP20142 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGCP20142 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGCP20142 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGCP20142 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGCP20142 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGCP20142 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGCP20142 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGCP20142 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGCP20142 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGCP20142 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGCP20142 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGCP20142 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGCP20142 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGCP20142 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGCP20142 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PGCP20142 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGCP20142 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGCP20142 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGCP20142 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGCP20142 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGCP20142 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PGCP20142 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PGCP20142 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGCP20142 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGCP20142 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGCP20142 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PGCP20142 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGCP20142 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGCP20142 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGCP20142 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.5 ms