Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFITM1P13164 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFITM1P13164 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFITM1P13164 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFITM1P13164 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFITM1P13164 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFITM1P13164 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFITM1P13164 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFITM1P13164 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFITM1P13164 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFITM1P13164 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFITM1P13164 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFITM1P13164 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFITM1P13164 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFITM1P13164 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFITM1P13164 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFITM1P13164 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFITM1P13164 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFITM1P13164 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFITM1P13164 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFITM1P13164 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFITM1P13164 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFITM1P13164 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFITM1P13164 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFITM1P13164 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFITM1P13164 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFITM1P13164 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFITM1P13164 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFITM1P13164 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFITM1P13164 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFITM1P13164 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFITM1P13164 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFITM1P13164 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFITM1P13164 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFITM1P13164 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFITM1P13164 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFITM1P13164 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFITM1P13164 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFITM1P13164 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFITM1P13164 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
IFITM1P13164 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFITM1P13164 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IFITM1P13164 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IFITM1P13164 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
IFITM1P13164 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IFITM1P13164 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFITM1P13164 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFITM1P13164 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFITM1P13164 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFITM1P13164 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFITM1P13164 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFITM1P13164 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFITM1P13164 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFITM1P13164 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFITM1P13164 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFITM1P13164 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFITM1P13164 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFITM1P13164 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFITM1P13164 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFITM1P13164 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
IFITM1P13164 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFITM1P13164 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFITM1P13164 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFITM1P13164 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFITM1P13164 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
IFITM1P13164 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFITM1P13164 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFITM1P13164 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
IFITM1P13164 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFITM1P13164 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFITM1P13164 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
IFITM1P13164 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFITM1P13164 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IFITM1P13164 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFITM1P13164 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFITM1P13164 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFITM1P13164 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
IFITM1P13164 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFITM1P13164 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
IFITM1P13164 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFITM1P13164 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFITM1P13164 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFITM1P13164 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFITM1P13164 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFITM1P13164 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFITM1P13164 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFITM1P13164 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFITM1P13164 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFITM1P13164 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFITM1P13164 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFITM1P13164 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFITM1P13164 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFITM1P13164 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFITM1P13164 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFITM1P13164 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFITM1P13164 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFITM1P13164 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFITM1P13164 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IFITM1P13164 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IFITM1P13164 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms