Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIN3BO75182 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIN3BO75182 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIN3BO75182 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIN3BO75182 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIN3BO75182 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIN3BO75182 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIN3BO75182 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SIN3BO75182 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIN3BO75182 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SIN3BO75182 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIN3BO75182 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIN3BO75182 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIN3BO75182 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SIN3BO75182 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIN3BO75182 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SIN3BO75182 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIN3BO75182 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIN3BO75182 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SIN3BO75182 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SIN3BO75182 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIN3BO75182 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIN3BO75182 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIN3BO75182 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIN3BO75182 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIN3BO75182 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIN3BO75182 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SIN3BO75182 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIN3BO75182 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIN3BO75182 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIN3BO75182 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIN3BO75182 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIN3BO75182 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SIN3BO75182 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIN3BO75182 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIN3BO75182 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIN3BO75182 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
SIN3BO75182 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SIN3BO75182 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SIN3BO75182 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SIN3BO75182 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIN3BO75182 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIN3BO75182 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIN3BO75182 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIN3BO75182 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIN3BO75182 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SIN3BO75182 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SIN3BO75182 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIN3BO75182 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIN3BO75182 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIN3BO75182 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIN3BO75182 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIN3BO75182 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIN3BO75182 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIN3BO75182 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIN3BO75182 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIN3BO75182 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIN3BO75182 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIN3BO75182 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SIN3BO75182 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIN3BO75182 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIN3BO75182 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIN3BO75182 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIN3BO75182 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIN3BO75182 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIN3BO75182 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIN3BO75182 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIN3BO75182 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIN3BO75182 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIN3BO75182 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIN3BO75182 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIN3BO75182 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIN3BO75182 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIN3BO75182 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIN3BO75182 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIN3BO75182 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIN3BO75182 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIN3BO75182 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIN3BO75182 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SIN3BO75182 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIN3BO75182 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIN3BO75182 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SIN3BO75182 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIN3BO75182 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIN3BO75182 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIN3BO75182 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIN3BO75182 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIN3BO75182 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIN3BO75182 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIN3BO75182 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIN3BO75182 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIN3BO75182 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIN3BO75182 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIN3BO75182 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIN3BO75182 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SIN3BO75182 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIN3BO75182 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIN3BO75182 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIN3BO75182 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIN3BO75182 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms