Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPFIA3O75145 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPFIA3O75145 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPFIA3O75145 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PPFIA3O75145 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PPFIA3O75145 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PPFIA3O75145 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PPFIA3O75145 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PPFIA3O75145 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PPFIA3O75145 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PPFIA3O75145 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PPFIA3O75145 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PPFIA3O75145 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PPFIA3O75145 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PPFIA3O75145 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PPFIA3O75145 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PPFIA3O75145 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PPFIA3O75145 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PPFIA3O75145 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PPFIA3O75145 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PPFIA3O75145 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PPFIA3O75145 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PPFIA3O75145 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PPFIA3O75145 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PPFIA3O75145 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PPFIA3O75145 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PPFIA3O75145 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PPFIA3O75145 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PPFIA3O75145 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PPFIA3O75145 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PPFIA3O75145 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PPFIA3O75145 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PPFIA3O75145 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PPFIA3O75145 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PPFIA3O75145 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PPFIA3O75145 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PPFIA3O75145 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PPFIA3O75145 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PPFIA3O75145 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PPFIA3O75145 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PPFIA3O75145 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PPFIA3O75145 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PPFIA3O75145 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PPFIA3O75145 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PPFIA3O75145 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PPFIA3O75145 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PPFIA3O75145 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PPFIA3O75145 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PPFIA3O75145 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PPFIA3O75145 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PPFIA3O75145 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPFIA3O75145 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPFIA3O75145 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PPFIA3O75145 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PPFIA3O75145 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PPFIA3O75145 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PPFIA3O75145 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PPFIA3O75145 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPFIA3O75145 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPFIA3O75145 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPFIA3O75145 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPFIA3O75145 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPFIA3O75145 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPFIA3O75145 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPFIA3O75145 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPFIA3O75145 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPFIA3O75145 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPFIA3O75145 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPFIA3O75145 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPFIA3O75145 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPFIA3O75145 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPFIA3O75145 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPFIA3O75145 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPFIA3O75145 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPFIA3O75145 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPFIA3O75145 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPFIA3O75145 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPFIA3O75145 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPFIA3O75145 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPFIA3O75145 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PPFIA3O75145 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PPFIA3O75145 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PPFIA3O75145 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPFIA3O75145 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPFIA3O75145 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPFIA3O75145 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPFIA3O75145 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPFIA3O75145 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPFIA3O75145 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPFIA3O75145 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPFIA3O75145 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPFIA3O75145 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPFIA3O75145 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPFIA3O75145 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPFIA3O75145 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPFIA3O75145 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPFIA3O75145 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PPFIA3O75145 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PPFIA3O75145 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PPFIA3O75145 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms