Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TARDBPQ13148 B2M-201ENST00000349264 732 ntTSL 35.78□□□□□ -1.484e-18■■□□□ 12.2
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TARDBPQ13148 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.94e-6■■□□□ 12
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TARDBPQ13148 TTC7B-202ENST00000553948 630 ntTSL 532.63■■■□□ 2.812e-6■■□□□ 12
TARDBPQ13148 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.472e-6■■□□□ 12
TARDBPQ13148 TMEM9-211ENST00000497582 1075 ntTSL 322.87■■□□□ 1.252e-6■■□□□ 12
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TARDBPQ13148 ATP6V0A2-205ENST00000540368 1479 ntTSL 1 (best)22.13■■□□□ 1.132e-6■■□□□ 12
TARDBPQ13148 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.022e-6■■□□□ 12
TARDBPQ13148 PAICS-203ENST00000504188 491 ntTSL 221.4■■□□□ 1.022e-6■■□□□ 12
TARDBPQ13148 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.872e-6■■□□□ 12
TARDBPQ13148 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.642e-6■■□□□ 12
TARDBPQ13148 TMEM9-206ENST00000435310 507 ntTSL 217.07■□□□□ 0.322e-6■■□□□ 12
TARDBPQ13148 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.222e-6■■□□□ 12
TARDBPQ13148 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.192e-6■■□□□ 12
TARDBPQ13148 CSNK1D-224ENST00000584672 401 ntTSL 314.94□□□□□ -0.022e-6■■□□□ 12
TARDBPQ13148 PAICS-204ENST00000505164 1514 ntTSL 214.6□□□□□ -0.072e-6■■□□□ 12
TARDBPQ13148 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.12e-6■■□□□ 12
TARDBPQ13148 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.242e-6■■□□□ 12
TARDBPQ13148 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.252e-6■■□□□ 12
TARDBPQ13148 ATP6V0A2-202ENST00000504192 2525 ntTSL 513.43□□□□□ -0.262e-6■■□□□ 12
TARDBPQ13148 TBC1D14-208ENST00000451522 4149 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.392e-6■■□□□ 12
TARDBPQ13148 TMEM9-210ENST00000495205 971 ntTSL 512.46□□□□□ -0.412e-6■■□□□ 12
TARDBPQ13148 TMX3-202ENST00000443099 913 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.462e-6■■□□□ 12
TARDBPQ13148 PAICS-206ENST00000510584 557 ntTSL 211.75□□□□□ -0.532e-6■■□□□ 12
TARDBPQ13148 TBC1D14-201ENST00000409757 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.562e-6■■□□□ 12
TARDBPQ13148 TMX3-210ENST00000569053 940 ntTSL 1 (best)11.23□□□□□ -0.612e-6■■□□□ 12
TARDBPQ13148 TMEM9-207ENST00000455367 487 ntTSL 511.15□□□□□ -0.622e-6■■□□□ 12
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