RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497582.5

TMEM9-211, Transcript of transmembrane protein 9, humanhuman

TSL 3

Gene TMEM9, Length 1,075 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM9-211ENST00000497582 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.1■■■■■ 6.57
TMEM9-211ENST00000497582 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.16■■■■■ 5.62
TMEM9-211ENST00000497582 ABCC9O60706 1549 aa49.94■■■■■ 5.58
TMEM9-211ENST00000497582 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.61■■■■■ 5.21
TMEM9-211ENST00000497582 NACADO15069 1562 aa47.35■■■■■ 5.17
TMEM9-211ENST00000497582 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.28■■■■■ 5.16
TMEM9-211ENST00000497582 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.77■■■■■ 5.08
TMEM9-211ENST00000497582 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.63■■■■■ 5.06
TMEM9-211ENST00000497582 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.62■■■■■ 5.05
TMEM9-211ENST00000497582 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.58■■■■■ 5.05
TMEM9-211ENST00000497582 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.54■■■■■ 5.04
TMEM9-211ENST00000497582 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.3■■■■■ 5
TMEM9-211ENST00000497582 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.27■■■■■ 5
TMEM9-211ENST00000497582 SCRIBQ14160 1630 aa45.79■■■■■ 4.92
TMEM9-211ENST00000497582 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.55■■■■■ 4.88
TMEM9-211ENST00000497582 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.11■■■■■ 4.81
TMEM9-211ENST00000497582 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.07■■■■■ 4.81
TMEM9-211ENST00000497582 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.91■■■■■ 4.78
TMEM9-211ENST00000497582 NCAPD3P42695 1498 aa43.72■■■■■ 4.59
TMEM9-211ENST00000497582 SMARCA4P51532 1647 aa43.7■■■■■ 4.59
TMEM9-211ENST00000497582 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.66■■■■■ 4.58
TMEM9-211ENST00000497582 SMARCA2P51531 1590 aa43.52■■■■■ 4.56
TMEM9-211ENST00000497582 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.5■■■■■ 4.55
TMEM9-211ENST00000497582 HMGXB3Q12766 1538 aa43.41■■■■■ 4.54
TMEM9-211ENST00000497582 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.27■■■■■ 4.52
TMEM9-211ENST00000497582 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.24■■■■■ 4.51
TMEM9-211ENST00000497582 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.23■■■■■ 4.51
TMEM9-211ENST00000497582 ERCC6Q03468 1493 aa43.05■■■■■ 4.48
TMEM9-211ENST00000497582 NESP48681 1621 aa43.01■■■■■ 4.48
TMEM9-211ENST00000497582 CUX2O14529 1486 aa42.83■■■■■ 4.45
TMEM9-211ENST00000497582 WIZO95785 1651 aa42.78■■■■■ 4.44
TMEM9-211ENST00000497582 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.68■■■■■ 4.42
TMEM9-211ENST00000497582 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.51■■■■■ 4.4
TMEM9-211ENST00000497582 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.47■■■■■ 4.39
TMEM9-211ENST00000497582 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.46■■■■■ 4.39
TMEM9-211ENST00000497582 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.45■■■■■ 4.39
TMEM9-211ENST00000497582 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.42■■■■■ 4.38
TMEM9-211ENST00000497582 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.42■■■■■ 4.38
TMEM9-211ENST00000497582 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.2■■■■■ 4.35
TMEM9-211ENST00000497582 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.05■■■■■ 4.32
TMEM9-211ENST00000497582 CFTRP13569 1480 aa42■■■■■ 4.31
TMEM9-211ENST00000497582 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.95■■■■■ 4.31
TMEM9-211ENST00000497582 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.94■■■■■ 4.3
TMEM9-211ENST00000497582 WDR62O43379 1518 aa41.93■■■■■ 4.3
TMEM9-211ENST00000497582 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.76■■■■■ 4.28
TMEM9-211ENST00000497582 PRDM2Q13029 1718 aa41.62■■■■■ 4.25
TMEM9-211ENST00000497582 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.61■■■■■ 4.25
TMEM9-211ENST00000497582 TOPBP1Q92547 1522 aa41.2■■■■■ 4.19
TMEM9-211ENST00000497582 IFT140Q96RY7 1462 aa41.09■■■■■ 4.17
TMEM9-211ENST00000497582 ABCC8Q09428 1581 aa41.08■■■■■ 4.17
TMEM9-211ENST00000497582 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.06■■■■■ 4.16
TMEM9-211ENST00000497582 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.06■■■■■ 4.16
TMEM9-211ENST00000497582 OSCARQ8IYS5 282 aa40.97■■■■■ 4.15
TMEM9-211ENST00000497582 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.88■■■■■ 4.13
TMEM9-211ENST00000497582 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.82■■■■■ 4.12
TMEM9-211ENST00000497582 TRIM41Q8WV44 630 aa40.81■■■■■ 4.12
TMEM9-211ENST00000497582 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.81■■■■■ 4.12
TMEM9-211ENST00000497582 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.79■■■■■ 4.12
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TMEM9-211ENST00000497582 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.69■■■■■ 4.1
TMEM9-211ENST00000497582 CUX1P39880 1505 aa40.62■■■■■ 4.09
TMEM9-211ENST00000497582 SOGA1O94964 1423 aa40.62■■■■■ 4.09
TMEM9-211ENST00000497582 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.59■■■■■ 4.09
TMEM9-211ENST00000497582 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.53■■■■■ 4.08
TMEM9-211ENST00000497582 CHD1O14646 1710 aa40.48■■■■■ 4.07
TMEM9-211ENST00000497582 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.42■■■■■ 4.06
TMEM9-211ENST00000497582 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.42■■■■■ 4.06
TMEM9-211ENST00000497582 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.42■■■■■ 4.06
TMEM9-211ENST00000497582 FBLN2P98095 1184 aa40.4■■■■■ 4.06
TMEM9-211ENST00000497582 WDR97A6NE52 1622 aa40.34■■■■■ 4.05
TMEM9-211ENST00000497582 ARHGEF11O15085 1522 aa40.32■■■■■ 4.04
TMEM9-211ENST00000497582 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.29■■■■■ 4.04
TMEM9-211ENST00000497582 GRIN2BQ13224 1484 aa40.2■■■■■ 4.03
TMEM9-211ENST00000497582 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.16■■■■■ 4.02
TMEM9-211ENST00000497582 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.13■■■■■ 4.01
TMEM9-211ENST00000497582 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.12■■■■■ 4.01
TMEM9-211ENST00000497582 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.12■■■■■ 4.01
TMEM9-211ENST00000497582 PBRM1Q86U86 1689 aa40.1■■■■■ 4.01
TMEM9-211ENST00000497582 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.05■■■■■ 4
TMEM9-211ENST00000497582 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.04■■■■■ 4
TMEM9-211ENST00000497582 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.03■■■■■ 4
TMEM9-211ENST00000497582 SYNJ2O15056 1496 aa40.03■■■■■ 4
TMEM9-211ENST00000497582 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.03■■■■■ 4
TMEM9-211ENST00000497582 TOP2BQ02880 1626 aa40.02■■■■■ 4
TMEM9-211ENST00000497582 SYNJ1O43426 1573 aa40.02■■■■■ 4
TMEM9-211ENST00000497582 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.99■■■■□ 3.99
TMEM9-211ENST00000497582 ARAP1Q96P48 1450 aa39.95■■■■□ 3.99
TMEM9-211ENST00000497582 ADAMTS12P58397 1594 aa39.72■■■■□ 3.95
TMEM9-211ENST00000497582 GRIN2AQ12879 1464 aa39.7■■■■□ 3.95
TMEM9-211ENST00000497582 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.62■■■■□ 3.93
TMEM9-211ENST00000497582 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.61■■■■□ 3.93
TMEM9-211ENST00000497582 CEP170Q5SW79 1584 aa39.57■■■■□ 3.92
TMEM9-211ENST00000497582 NUP160Q12769 1436 aa39.56■■■■□ 3.92
TMEM9-211ENST00000497582 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.47■■■■□ 3.91
TMEM9-211ENST00000497582 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.46■■■■□ 3.91
TMEM9-211ENST00000497582 SHROOM2Q13796 1616 aa39.35■■■■□ 3.89
TMEM9-211ENST00000497582 KIF27Q86VH2 1401 aa39.24■■■■□ 3.87
TMEM9-211ENST00000497582 IGF1RP08069 1367 aa39.23■■■■□ 3.87
TMEM9-211ENST00000497582 JPH4Q96JJ6 628 aa39.18■■■■□ 3.86
TMEM9-211ENST00000497582 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.17■■■■□ 3.86
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