Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2H6

FNDC3A, Fibronectin type-III domain-containing protein 3A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC3AQ9Y2H6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FNDC3AQ9Y2H6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FNDC3AQ9Y2H6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FNDC3AQ9Y2H6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FNDC3AQ9Y2H6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FNDC3AQ9Y2H6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FNDC3AQ9Y2H6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FNDC3AQ9Y2H6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FNDC3AQ9Y2H6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FNDC3AQ9Y2H6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
FNDC3AQ9Y2H6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FNDC3AQ9Y2H6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FNDC3AQ9Y2H6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FNDC3AQ9Y2H6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FNDC3AQ9Y2H6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FNDC3AQ9Y2H6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FNDC3AQ9Y2H6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
FNDC3AQ9Y2H6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
FNDC3AQ9Y2H6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FNDC3AQ9Y2H6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FNDC3AQ9Y2H6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FNDC3AQ9Y2H6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FNDC3AQ9Y2H6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FNDC3AQ9Y2H6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FNDC3AQ9Y2H6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FNDC3AQ9Y2H6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FNDC3AQ9Y2H6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FNDC3AQ9Y2H6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FNDC3AQ9Y2H6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FNDC3AQ9Y2H6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FNDC3AQ9Y2H6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FNDC3AQ9Y2H6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FNDC3AQ9Y2H6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FNDC3AQ9Y2H6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FNDC3AQ9Y2H6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FNDC3AQ9Y2H6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FNDC3AQ9Y2H6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FNDC3AQ9Y2H6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FNDC3AQ9Y2H6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FNDC3AQ9Y2H6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
FNDC3AQ9Y2H6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FNDC3AQ9Y2H6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FNDC3AQ9Y2H6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FNDC3AQ9Y2H6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FNDC3AQ9Y2H6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FNDC3AQ9Y2H6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FNDC3AQ9Y2H6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FNDC3AQ9Y2H6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FNDC3AQ9Y2H6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FNDC3AQ9Y2H6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FNDC3AQ9Y2H6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FNDC3AQ9Y2H6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FNDC3AQ9Y2H6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FNDC3AQ9Y2H6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FNDC3AQ9Y2H6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FNDC3AQ9Y2H6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FNDC3AQ9Y2H6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FNDC3AQ9Y2H6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FNDC3AQ9Y2H6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FNDC3AQ9Y2H6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FNDC3AQ9Y2H6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FNDC3AQ9Y2H6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FNDC3AQ9Y2H6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FNDC3AQ9Y2H6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FNDC3AQ9Y2H6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FNDC3AQ9Y2H6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FNDC3AQ9Y2H6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
FNDC3AQ9Y2H6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
FNDC3AQ9Y2H6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FNDC3AQ9Y2H6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FNDC3AQ9Y2H6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
FNDC3AQ9Y2H6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FNDC3AQ9Y2H6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FNDC3AQ9Y2H6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FNDC3AQ9Y2H6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FNDC3AQ9Y2H6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FNDC3AQ9Y2H6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FNDC3AQ9Y2H6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FNDC3AQ9Y2H6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FNDC3AQ9Y2H6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
FNDC3AQ9Y2H6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
FNDC3AQ9Y2H6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FNDC3AQ9Y2H6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FNDC3AQ9Y2H6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FNDC3AQ9Y2H6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
FNDC3AQ9Y2H6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FNDC3AQ9Y2H6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FNDC3AQ9Y2H6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FNDC3AQ9Y2H6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FNDC3AQ9Y2H6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FNDC3AQ9Y2H6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FNDC3AQ9Y2H6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
FNDC3AQ9Y2H6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FNDC3AQ9Y2H6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FNDC3AQ9Y2H6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FNDC3AQ9Y2H6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FNDC3AQ9Y2H6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FNDC3AQ9Y2H6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FNDC3AQ9Y2H6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FNDC3AQ9Y2H6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88 ms