Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCE1Q9Y256 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCE1Q9Y256 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCE1Q9Y256 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCE1Q9Y256 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCE1Q9Y256 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCE1Q9Y256 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCE1Q9Y256 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCE1Q9Y256 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCE1Q9Y256 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCE1Q9Y256 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCE1Q9Y256 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RCE1Q9Y256 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RCE1Q9Y256 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RCE1Q9Y256 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RCE1Q9Y256 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RCE1Q9Y256 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RCE1Q9Y256 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RCE1Q9Y256 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCE1Q9Y256 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCE1Q9Y256 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RCE1Q9Y256 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RCE1Q9Y256 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RCE1Q9Y256 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RCE1Q9Y256 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RCE1Q9Y256 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RCE1Q9Y256 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCE1Q9Y256 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCE1Q9Y256 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCE1Q9Y256 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCE1Q9Y256 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCE1Q9Y256 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCE1Q9Y256 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCE1Q9Y256 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RCE1Q9Y256 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCE1Q9Y256 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCE1Q9Y256 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCE1Q9Y256 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCE1Q9Y256 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCE1Q9Y256 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCE1Q9Y256 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCE1Q9Y256 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCE1Q9Y256 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCE1Q9Y256 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCE1Q9Y256 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCE1Q9Y256 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCE1Q9Y256 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCE1Q9Y256 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCE1Q9Y256 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCE1Q9Y256 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCE1Q9Y256 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCE1Q9Y256 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCE1Q9Y256 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RCE1Q9Y256 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RCE1Q9Y256 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RCE1Q9Y256 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RCE1Q9Y256 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RCE1Q9Y256 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RCE1Q9Y256 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RCE1Q9Y256 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RCE1Q9Y256 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RCE1Q9Y256 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RCE1Q9Y256 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RCE1Q9Y256 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RCE1Q9Y256 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RCE1Q9Y256 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RCE1Q9Y256 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RCE1Q9Y256 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RCE1Q9Y256 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RCE1Q9Y256 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RCE1Q9Y256 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RCE1Q9Y256 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RCE1Q9Y256 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RCE1Q9Y256 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RCE1Q9Y256 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RCE1Q9Y256 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RCE1Q9Y256 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RCE1Q9Y256 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RCE1Q9Y256 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RCE1Q9Y256 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
RCE1Q9Y256 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RCE1Q9Y256 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RCE1Q9Y256 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RCE1Q9Y256 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RCE1Q9Y256 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RCE1Q9Y256 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RCE1Q9Y256 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RCE1Q9Y256 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RCE1Q9Y256 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RCE1Q9Y256 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RCE1Q9Y256 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RCE1Q9Y256 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RCE1Q9Y256 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RCE1Q9Y256 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RCE1Q9Y256 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RCE1Q9Y256 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RCE1Q9Y256 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RCE1Q9Y256 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RCE1Q9Y256 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RCE1Q9Y256 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms