Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB5

CDH7, Cadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH7Q9ULB5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CDH7Q9ULB5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CDH7Q9ULB5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDH7Q9ULB5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDH7Q9ULB5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDH7Q9ULB5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDH7Q9ULB5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CDH7Q9ULB5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDH7Q9ULB5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDH7Q9ULB5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDH7Q9ULB5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CDH7Q9ULB5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDH7Q9ULB5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDH7Q9ULB5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDH7Q9ULB5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDH7Q9ULB5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDH7Q9ULB5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDH7Q9ULB5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDH7Q9ULB5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDH7Q9ULB5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDH7Q9ULB5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDH7Q9ULB5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDH7Q9ULB5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDH7Q9ULB5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDH7Q9ULB5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDH7Q9ULB5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDH7Q9ULB5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
CDH7Q9ULB5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDH7Q9ULB5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDH7Q9ULB5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDH7Q9ULB5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDH7Q9ULB5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDH7Q9ULB5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDH7Q9ULB5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDH7Q9ULB5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDH7Q9ULB5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDH7Q9ULB5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CDH7Q9ULB5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDH7Q9ULB5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDH7Q9ULB5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDH7Q9ULB5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDH7Q9ULB5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDH7Q9ULB5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDH7Q9ULB5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDH7Q9ULB5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDH7Q9ULB5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDH7Q9ULB5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDH7Q9ULB5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDH7Q9ULB5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDH7Q9ULB5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDH7Q9ULB5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDH7Q9ULB5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDH7Q9ULB5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDH7Q9ULB5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDH7Q9ULB5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDH7Q9ULB5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDH7Q9ULB5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDH7Q9ULB5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CDH7Q9ULB5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDH7Q9ULB5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDH7Q9ULB5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDH7Q9ULB5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDH7Q9ULB5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDH7Q9ULB5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDH7Q9ULB5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDH7Q9ULB5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDH7Q9ULB5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDH7Q9ULB5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDH7Q9ULB5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDH7Q9ULB5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDH7Q9ULB5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDH7Q9ULB5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDH7Q9ULB5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDH7Q9ULB5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDH7Q9ULB5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDH7Q9ULB5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDH7Q9ULB5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDH7Q9ULB5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CDH7Q9ULB5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDH7Q9ULB5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CDH7Q9ULB5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDH7Q9ULB5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDH7Q9ULB5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDH7Q9ULB5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CDH7Q9ULB5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDH7Q9ULB5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDH7Q9ULB5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDH7Q9ULB5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDH7Q9ULB5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDH7Q9ULB5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CDH7Q9ULB5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDH7Q9ULB5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDH7Q9ULB5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDH7Q9ULB5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
CDH7Q9ULB5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CDH7Q9ULB5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDH7Q9ULB5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDH7Q9ULB5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDH7Q9ULB5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDH7Q9ULB5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms