Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCMF1Q9P0J7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KCMF1Q9P0J7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCMF1Q9P0J7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KCMF1Q9P0J7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCMF1Q9P0J7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCMF1Q9P0J7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCMF1Q9P0J7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCMF1Q9P0J7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCMF1Q9P0J7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCMF1Q9P0J7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCMF1Q9P0J7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KCMF1Q9P0J7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCMF1Q9P0J7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KCMF1Q9P0J7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCMF1Q9P0J7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCMF1Q9P0J7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCMF1Q9P0J7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCMF1Q9P0J7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCMF1Q9P0J7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCMF1Q9P0J7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCMF1Q9P0J7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCMF1Q9P0J7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCMF1Q9P0J7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCMF1Q9P0J7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCMF1Q9P0J7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCMF1Q9P0J7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCMF1Q9P0J7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCMF1Q9P0J7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCMF1Q9P0J7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCMF1Q9P0J7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCMF1Q9P0J7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCMF1Q9P0J7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCMF1Q9P0J7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCMF1Q9P0J7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCMF1Q9P0J7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCMF1Q9P0J7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCMF1Q9P0J7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCMF1Q9P0J7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCMF1Q9P0J7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCMF1Q9P0J7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCMF1Q9P0J7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCMF1Q9P0J7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCMF1Q9P0J7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCMF1Q9P0J7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCMF1Q9P0J7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCMF1Q9P0J7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCMF1Q9P0J7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KCMF1Q9P0J7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCMF1Q9P0J7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCMF1Q9P0J7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCMF1Q9P0J7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCMF1Q9P0J7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCMF1Q9P0J7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCMF1Q9P0J7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCMF1Q9P0J7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCMF1Q9P0J7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCMF1Q9P0J7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCMF1Q9P0J7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCMF1Q9P0J7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCMF1Q9P0J7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCMF1Q9P0J7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCMF1Q9P0J7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCMF1Q9P0J7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCMF1Q9P0J7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCMF1Q9P0J7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCMF1Q9P0J7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCMF1Q9P0J7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCMF1Q9P0J7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
KCMF1Q9P0J7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCMF1Q9P0J7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCMF1Q9P0J7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCMF1Q9P0J7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCMF1Q9P0J7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCMF1Q9P0J7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCMF1Q9P0J7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCMF1Q9P0J7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCMF1Q9P0J7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCMF1Q9P0J7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCMF1Q9P0J7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCMF1Q9P0J7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KCMF1Q9P0J7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KCMF1Q9P0J7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KCMF1Q9P0J7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KCMF1Q9P0J7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCMF1Q9P0J7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCMF1Q9P0J7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KCMF1Q9P0J7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCMF1Q9P0J7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCMF1Q9P0J7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCMF1Q9P0J7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCMF1Q9P0J7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCMF1Q9P0J7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCMF1Q9P0J7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCMF1Q9P0J7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCMF1Q9P0J7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCMF1Q9P0J7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCMF1Q9P0J7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCMF1Q9P0J7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCMF1Q9P0J7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms