Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX70

MED29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED29Q9NX70 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED29Q9NX70 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED29Q9NX70 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED29Q9NX70 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED29Q9NX70 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED29Q9NX70 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED29Q9NX70 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED29Q9NX70 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED29Q9NX70 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED29Q9NX70 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MED29Q9NX70 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MED29Q9NX70 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MED29Q9NX70 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MED29Q9NX70 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MED29Q9NX70 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MED29Q9NX70 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MED29Q9NX70 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MED29Q9NX70 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MED29Q9NX70 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MED29Q9NX70 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MED29Q9NX70 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MED29Q9NX70 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MED29Q9NX70 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MED29Q9NX70 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MED29Q9NX70 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MED29Q9NX70 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MED29Q9NX70 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MED29Q9NX70 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MED29Q9NX70 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MED29Q9NX70 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MED29Q9NX70 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MED29Q9NX70 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MED29Q9NX70 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MED29Q9NX70 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MED29Q9NX70 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MED29Q9NX70 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MED29Q9NX70 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MED29Q9NX70 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MED29Q9NX70 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MED29Q9NX70 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MED29Q9NX70 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MED29Q9NX70 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MED29Q9NX70 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MED29Q9NX70 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MED29Q9NX70 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MED29Q9NX70 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MED29Q9NX70 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MED29Q9NX70 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MED29Q9NX70 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MED29Q9NX70 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MED29Q9NX70 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MED29Q9NX70 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MED29Q9NX70 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MED29Q9NX70 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MED29Q9NX70 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MED29Q9NX70 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MED29Q9NX70 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MED29Q9NX70 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MED29Q9NX70 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
MED29Q9NX70 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MED29Q9NX70 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MED29Q9NX70 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MED29Q9NX70 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MED29Q9NX70 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MED29Q9NX70 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MED29Q9NX70 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MED29Q9NX70 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MED29Q9NX70 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MED29Q9NX70 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MED29Q9NX70 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MED29Q9NX70 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MED29Q9NX70 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MED29Q9NX70 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MED29Q9NX70 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MED29Q9NX70 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MED29Q9NX70 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MED29Q9NX70 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MED29Q9NX70 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MED29Q9NX70 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MED29Q9NX70 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MED29Q9NX70 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MED29Q9NX70 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MED29Q9NX70 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MED29Q9NX70 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MED29Q9NX70 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MED29Q9NX70 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MED29Q9NX70 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MED29Q9NX70 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MED29Q9NX70 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MED29Q9NX70 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MED29Q9NX70 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MED29Q9NX70 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MED29Q9NX70 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MED29Q9NX70 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MED29Q9NX70 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MED29Q9NX70 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MED29Q9NX70 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MED29Q9NX70 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MED29Q9NX70 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MED29Q9NX70 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms