Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3P7

ACBD3, Golgi resident protein GCP60, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD3Q9H3P7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACBD3Q9H3P7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACBD3Q9H3P7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACBD3Q9H3P7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACBD3Q9H3P7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACBD3Q9H3P7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACBD3Q9H3P7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACBD3Q9H3P7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACBD3Q9H3P7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACBD3Q9H3P7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACBD3Q9H3P7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ACBD3Q9H3P7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ACBD3Q9H3P7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACBD3Q9H3P7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACBD3Q9H3P7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACBD3Q9H3P7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ACBD3Q9H3P7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACBD3Q9H3P7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACBD3Q9H3P7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACBD3Q9H3P7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACBD3Q9H3P7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACBD3Q9H3P7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACBD3Q9H3P7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACBD3Q9H3P7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACBD3Q9H3P7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACBD3Q9H3P7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACBD3Q9H3P7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACBD3Q9H3P7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACBD3Q9H3P7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACBD3Q9H3P7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACBD3Q9H3P7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACBD3Q9H3P7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACBD3Q9H3P7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACBD3Q9H3P7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACBD3Q9H3P7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACBD3Q9H3P7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACBD3Q9H3P7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACBD3Q9H3P7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACBD3Q9H3P7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACBD3Q9H3P7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACBD3Q9H3P7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACBD3Q9H3P7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACBD3Q9H3P7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACBD3Q9H3P7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACBD3Q9H3P7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ACBD3Q9H3P7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ACBD3Q9H3P7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ACBD3Q9H3P7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ACBD3Q9H3P7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ACBD3Q9H3P7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ACBD3Q9H3P7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ACBD3Q9H3P7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ACBD3Q9H3P7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACBD3Q9H3P7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACBD3Q9H3P7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACBD3Q9H3P7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACBD3Q9H3P7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACBD3Q9H3P7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACBD3Q9H3P7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACBD3Q9H3P7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACBD3Q9H3P7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ACBD3Q9H3P7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACBD3Q9H3P7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACBD3Q9H3P7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACBD3Q9H3P7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACBD3Q9H3P7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACBD3Q9H3P7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACBD3Q9H3P7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACBD3Q9H3P7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACBD3Q9H3P7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACBD3Q9H3P7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACBD3Q9H3P7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ACBD3Q9H3P7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACBD3Q9H3P7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACBD3Q9H3P7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACBD3Q9H3P7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACBD3Q9H3P7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACBD3Q9H3P7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACBD3Q9H3P7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACBD3Q9H3P7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACBD3Q9H3P7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACBD3Q9H3P7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACBD3Q9H3P7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACBD3Q9H3P7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACBD3Q9H3P7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACBD3Q9H3P7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACBD3Q9H3P7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACBD3Q9H3P7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACBD3Q9H3P7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACBD3Q9H3P7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACBD3Q9H3P7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACBD3Q9H3P7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACBD3Q9H3P7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACBD3Q9H3P7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACBD3Q9H3P7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACBD3Q9H3P7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACBD3Q9H3P7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACBD3Q9H3P7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ACBD3Q9H3P7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACBD3Q9H3P7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms