Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2J2Q9GZM3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2J2Q9GZM3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2J2Q9GZM3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2J2Q9GZM3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2J2Q9GZM3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2J2Q9GZM3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2J2Q9GZM3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2J2Q9GZM3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
POLR2J2Q9GZM3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2J2Q9GZM3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2J2Q9GZM3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2J2Q9GZM3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2J2Q9GZM3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2J2Q9GZM3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2J2Q9GZM3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2J2Q9GZM3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2J2Q9GZM3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2J2Q9GZM3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2J2Q9GZM3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2J2Q9GZM3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2J2Q9GZM3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2J2Q9GZM3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2J2Q9GZM3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2J2Q9GZM3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2J2Q9GZM3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2J2Q9GZM3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2J2Q9GZM3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2J2Q9GZM3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2J2Q9GZM3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2J2Q9GZM3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2J2Q9GZM3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2J2Q9GZM3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2J2Q9GZM3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2J2Q9GZM3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2J2Q9GZM3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2J2Q9GZM3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2J2Q9GZM3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2J2Q9GZM3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2J2Q9GZM3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2J2Q9GZM3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2J2Q9GZM3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2J2Q9GZM3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2J2Q9GZM3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2J2Q9GZM3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2J2Q9GZM3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2J2Q9GZM3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2J2Q9GZM3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2J2Q9GZM3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2J2Q9GZM3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2J2Q9GZM3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2J2Q9GZM3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2J2Q9GZM3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2J2Q9GZM3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2J2Q9GZM3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2J2Q9GZM3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2J2Q9GZM3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2J2Q9GZM3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2J2Q9GZM3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2J2Q9GZM3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2J2Q9GZM3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2J2Q9GZM3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2J2Q9GZM3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2J2Q9GZM3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2J2Q9GZM3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2J2Q9GZM3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
POLR2J2Q9GZM3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2J2Q9GZM3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2J2Q9GZM3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2J2Q9GZM3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2J2Q9GZM3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR2J2Q9GZM3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR2J2Q9GZM3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR2J2Q9GZM3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR2J2Q9GZM3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR2J2Q9GZM3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2J2Q9GZM3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2J2Q9GZM3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2J2Q9GZM3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2J2Q9GZM3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2J2Q9GZM3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2J2Q9GZM3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2J2Q9GZM3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2J2Q9GZM3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2J2Q9GZM3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2J2Q9GZM3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2J2Q9GZM3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2J2Q9GZM3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2J2Q9GZM3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2J2Q9GZM3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2J2Q9GZM3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2J2Q9GZM3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2J2Q9GZM3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2J2Q9GZM3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2J2Q9GZM3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2J2Q9GZM3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2J2Q9GZM3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2J2Q9GZM3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2J2Q9GZM3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2J2Q9GZM3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms