Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ95

NSD3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3Q9BZ95 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
NSD3Q9BZ95 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NSD3Q9BZ95 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
NSD3Q9BZ95 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NSD3Q9BZ95 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NSD3Q9BZ95 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
NSD3Q9BZ95 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
NSD3Q9BZ95 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NSD3Q9BZ95 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
NSD3Q9BZ95 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
NSD3Q9BZ95 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
NSD3Q9BZ95 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
NSD3Q9BZ95 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
NSD3Q9BZ95 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
NSD3Q9BZ95 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
NSD3Q9BZ95 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
NSD3Q9BZ95 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
NSD3Q9BZ95 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
NSD3Q9BZ95 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
NSD3Q9BZ95 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC33.69■■■□□ 2.98
NSD3Q9BZ95 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NSD3Q9BZ95 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NSD3Q9BZ95 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
NSD3Q9BZ95 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NSD3Q9BZ95 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
NSD3Q9BZ95 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
NSD3Q9BZ95 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC33.66■■■□□ 2.98
NSD3Q9BZ95 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
NSD3Q9BZ95 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NSD3Q9BZ95 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NSD3Q9BZ95 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
NSD3Q9BZ95 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
NSD3Q9BZ95 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
NSD3Q9BZ95 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
NSD3Q9BZ95 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
NSD3Q9BZ95 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NSD3Q9BZ95 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
NSD3Q9BZ95 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
NSD3Q9BZ95 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
NSD3Q9BZ95 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
NSD3Q9BZ95 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
NSD3Q9BZ95 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
NSD3Q9BZ95 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NSD3Q9BZ95 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NSD3Q9BZ95 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
NSD3Q9BZ95 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NSD3Q9BZ95 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
NSD3Q9BZ95 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NSD3Q9BZ95 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
NSD3Q9BZ95 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
NSD3Q9BZ95 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
NSD3Q9BZ95 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC33.58■■■□□ 2.97
NSD3Q9BZ95 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NSD3Q9BZ95 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NSD3Q9BZ95 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
NSD3Q9BZ95 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NSD3Q9BZ95 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NSD3Q9BZ95 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
NSD3Q9BZ95 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NSD3Q9BZ95 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NSD3Q9BZ95 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
NSD3Q9BZ95 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
NSD3Q9BZ95 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NSD3Q9BZ95 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NSD3Q9BZ95 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NSD3Q9BZ95 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NSD3Q9BZ95 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
NSD3Q9BZ95 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
NSD3Q9BZ95 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
NSD3Q9BZ95 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
NSD3Q9BZ95 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
NSD3Q9BZ95 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
NSD3Q9BZ95 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
NSD3Q9BZ95 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
NSD3Q9BZ95 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
NSD3Q9BZ95 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
NSD3Q9BZ95 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.96
NSD3Q9BZ95 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NSD3Q9BZ95 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
NSD3Q9BZ95 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
NSD3Q9BZ95 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
NSD3Q9BZ95 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
NSD3Q9BZ95 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
NSD3Q9BZ95 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NSD3Q9BZ95 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NSD3Q9BZ95 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
NSD3Q9BZ95 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NSD3Q9BZ95 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
NSD3Q9BZ95 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
NSD3Q9BZ95 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
NSD3Q9BZ95 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
NSD3Q9BZ95 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
NSD3Q9BZ95 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
NSD3Q9BZ95 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
NSD3Q9BZ95 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
NSD3Q9BZ95 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
NSD3Q9BZ95 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NSD3Q9BZ95 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NSD3Q9BZ95 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
NSD3Q9BZ95 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms