Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL4

SELENOO, Selenoprotein O, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOOQ9BVL4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SELENOOQ9BVL4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SELENOOQ9BVL4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SELENOOQ9BVL4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SELENOOQ9BVL4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SELENOOQ9BVL4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SELENOOQ9BVL4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SELENOOQ9BVL4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SELENOOQ9BVL4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SELENOOQ9BVL4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SELENOOQ9BVL4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SELENOOQ9BVL4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SELENOOQ9BVL4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SELENOOQ9BVL4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SELENOOQ9BVL4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SELENOOQ9BVL4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SELENOOQ9BVL4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SELENOOQ9BVL4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SELENOOQ9BVL4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SELENOOQ9BVL4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SELENOOQ9BVL4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SELENOOQ9BVL4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SELENOOQ9BVL4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SELENOOQ9BVL4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SELENOOQ9BVL4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SELENOOQ9BVL4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SELENOOQ9BVL4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SELENOOQ9BVL4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SELENOOQ9BVL4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SELENOOQ9BVL4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SELENOOQ9BVL4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SELENOOQ9BVL4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SELENOOQ9BVL4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SELENOOQ9BVL4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SELENOOQ9BVL4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SELENOOQ9BVL4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SELENOOQ9BVL4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SELENOOQ9BVL4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SELENOOQ9BVL4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SELENOOQ9BVL4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SELENOOQ9BVL4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SELENOOQ9BVL4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SELENOOQ9BVL4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SELENOOQ9BVL4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SELENOOQ9BVL4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SELENOOQ9BVL4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SELENOOQ9BVL4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SELENOOQ9BVL4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SELENOOQ9BVL4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SELENOOQ9BVL4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SELENOOQ9BVL4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SELENOOQ9BVL4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SELENOOQ9BVL4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SELENOOQ9BVL4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SELENOOQ9BVL4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SELENOOQ9BVL4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SELENOOQ9BVL4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SELENOOQ9BVL4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SELENOOQ9BVL4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SELENOOQ9BVL4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SELENOOQ9BVL4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SELENOOQ9BVL4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SELENOOQ9BVL4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SELENOOQ9BVL4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SELENOOQ9BVL4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SELENOOQ9BVL4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SELENOOQ9BVL4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SELENOOQ9BVL4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SELENOOQ9BVL4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SELENOOQ9BVL4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SELENOOQ9BVL4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SELENOOQ9BVL4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SELENOOQ9BVL4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SELENOOQ9BVL4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SELENOOQ9BVL4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SELENOOQ9BVL4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SELENOOQ9BVL4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SELENOOQ9BVL4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SELENOOQ9BVL4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SELENOOQ9BVL4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SELENOOQ9BVL4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SELENOOQ9BVL4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SELENOOQ9BVL4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SELENOOQ9BVL4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SELENOOQ9BVL4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SELENOOQ9BVL4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SELENOOQ9BVL4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SELENOOQ9BVL4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SELENOOQ9BVL4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SELENOOQ9BVL4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SELENOOQ9BVL4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SELENOOQ9BVL4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SELENOOQ9BVL4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SELENOOQ9BVL4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SELENOOQ9BVL4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SELENOOQ9BVL4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SELENOOQ9BVL4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SELENOOQ9BVL4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SELENOOQ9BVL4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SELENOOQ9BVL4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms