Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HERPUD2Q9BSE4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HERPUD2Q9BSE4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HERPUD2Q9BSE4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HERPUD2Q9BSE4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HERPUD2Q9BSE4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HERPUD2Q9BSE4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HERPUD2Q9BSE4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HERPUD2Q9BSE4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HERPUD2Q9BSE4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
HERPUD2Q9BSE4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HERPUD2Q9BSE4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HERPUD2Q9BSE4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HERPUD2Q9BSE4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HERPUD2Q9BSE4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HERPUD2Q9BSE4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HERPUD2Q9BSE4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HERPUD2Q9BSE4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HERPUD2Q9BSE4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HERPUD2Q9BSE4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
HERPUD2Q9BSE4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HERPUD2Q9BSE4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HERPUD2Q9BSE4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HERPUD2Q9BSE4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HERPUD2Q9BSE4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HERPUD2Q9BSE4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HERPUD2Q9BSE4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HERPUD2Q9BSE4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HERPUD2Q9BSE4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HERPUD2Q9BSE4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HERPUD2Q9BSE4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HERPUD2Q9BSE4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HERPUD2Q9BSE4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HERPUD2Q9BSE4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HERPUD2Q9BSE4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HERPUD2Q9BSE4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HERPUD2Q9BSE4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HERPUD2Q9BSE4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HERPUD2Q9BSE4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HERPUD2Q9BSE4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HERPUD2Q9BSE4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HERPUD2Q9BSE4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HERPUD2Q9BSE4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HERPUD2Q9BSE4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HERPUD2Q9BSE4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HERPUD2Q9BSE4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
HERPUD2Q9BSE4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
HERPUD2Q9BSE4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
HERPUD2Q9BSE4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HERPUD2Q9BSE4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HERPUD2Q9BSE4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
HERPUD2Q9BSE4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HERPUD2Q9BSE4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HERPUD2Q9BSE4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HERPUD2Q9BSE4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HERPUD2Q9BSE4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HERPUD2Q9BSE4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HERPUD2Q9BSE4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HERPUD2Q9BSE4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HERPUD2Q9BSE4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HERPUD2Q9BSE4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HERPUD2Q9BSE4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HERPUD2Q9BSE4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HERPUD2Q9BSE4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HERPUD2Q9BSE4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HERPUD2Q9BSE4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HERPUD2Q9BSE4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HERPUD2Q9BSE4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HERPUD2Q9BSE4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HERPUD2Q9BSE4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HERPUD2Q9BSE4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HERPUD2Q9BSE4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HERPUD2Q9BSE4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HERPUD2Q9BSE4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HERPUD2Q9BSE4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HERPUD2Q9BSE4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HERPUD2Q9BSE4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HERPUD2Q9BSE4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HERPUD2Q9BSE4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HERPUD2Q9BSE4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HERPUD2Q9BSE4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HERPUD2Q9BSE4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HERPUD2Q9BSE4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HERPUD2Q9BSE4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HERPUD2Q9BSE4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HERPUD2Q9BSE4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HERPUD2Q9BSE4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HERPUD2Q9BSE4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HERPUD2Q9BSE4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HERPUD2Q9BSE4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HERPUD2Q9BSE4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HERPUD2Q9BSE4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HERPUD2Q9BSE4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HERPUD2Q9BSE4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HERPUD2Q9BSE4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HERPUD2Q9BSE4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HERPUD2Q9BSE4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HERPUD2Q9BSE4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HERPUD2Q9BSE4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HERPUD2Q9BSE4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms