Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN8

TSSK3, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK3Q96PN8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TSSK3Q96PN8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TSSK3Q96PN8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TSSK3Q96PN8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TSSK3Q96PN8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSSK3Q96PN8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSSK3Q96PN8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSSK3Q96PN8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSSK3Q96PN8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TSSK3Q96PN8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSSK3Q96PN8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSSK3Q96PN8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSSK3Q96PN8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSSK3Q96PN8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSSK3Q96PN8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TSSK3Q96PN8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSSK3Q96PN8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSSK3Q96PN8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TSSK3Q96PN8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms