Protein–RNA interactions for Protein: Q96NG5

ZNF558, Zinc finger protein 558, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF558Q96NG5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF558Q96NG5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF558Q96NG5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF558Q96NG5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF558Q96NG5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF558Q96NG5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF558Q96NG5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF558Q96NG5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF558Q96NG5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF558Q96NG5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF558Q96NG5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF558Q96NG5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF558Q96NG5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF558Q96NG5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF558Q96NG5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF558Q96NG5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF558Q96NG5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNF558Q96NG5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNF558Q96NG5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNF558Q96NG5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNF558Q96NG5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNF558Q96NG5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNF558Q96NG5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNF558Q96NG5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNF558Q96NG5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ZNF558Q96NG5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF558Q96NG5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF558Q96NG5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF558Q96NG5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF558Q96NG5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF558Q96NG5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF558Q96NG5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF558Q96NG5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF558Q96NG5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF558Q96NG5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF558Q96NG5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF558Q96NG5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF558Q96NG5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF558Q96NG5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF558Q96NG5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF558Q96NG5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF558Q96NG5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF558Q96NG5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF558Q96NG5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF558Q96NG5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF558Q96NG5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF558Q96NG5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF558Q96NG5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF558Q96NG5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF558Q96NG5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF558Q96NG5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF558Q96NG5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF558Q96NG5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF558Q96NG5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF558Q96NG5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF558Q96NG5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF558Q96NG5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF558Q96NG5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF558Q96NG5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF558Q96NG5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF558Q96NG5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZNF558Q96NG5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZNF558Q96NG5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZNF558Q96NG5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZNF558Q96NG5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZNF558Q96NG5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZNF558Q96NG5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZNF558Q96NG5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZNF558Q96NG5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZNF558Q96NG5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZNF558Q96NG5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZNF558Q96NG5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZNF558Q96NG5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZNF558Q96NG5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZNF558Q96NG5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZNF558Q96NG5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZNF558Q96NG5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZNF558Q96NG5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZNF558Q96NG5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZNF558Q96NG5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZNF558Q96NG5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF558Q96NG5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF558Q96NG5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF558Q96NG5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF558Q96NG5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF558Q96NG5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF558Q96NG5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF558Q96NG5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF558Q96NG5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF558Q96NG5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF558Q96NG5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF558Q96NG5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF558Q96NG5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF558Q96NG5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF558Q96NG5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF558Q96NG5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF558Q96NG5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF558Q96NG5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF558Q96NG5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF558Q96NG5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.6 ms