Protein–RNA interactions for Protein: Q96JX3

SERAC1, Protein SERAC1, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERAC1Q96JX3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SERAC1Q96JX3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SERAC1Q96JX3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SERAC1Q96JX3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SERAC1Q96JX3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SERAC1Q96JX3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SERAC1Q96JX3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SERAC1Q96JX3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SERAC1Q96JX3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SERAC1Q96JX3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SERAC1Q96JX3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SERAC1Q96JX3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SERAC1Q96JX3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SERAC1Q96JX3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SERAC1Q96JX3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SERAC1Q96JX3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SERAC1Q96JX3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SERAC1Q96JX3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SERAC1Q96JX3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SERAC1Q96JX3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SERAC1Q96JX3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SERAC1Q96JX3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SERAC1Q96JX3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SERAC1Q96JX3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SERAC1Q96JX3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SERAC1Q96JX3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SERAC1Q96JX3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SERAC1Q96JX3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SERAC1Q96JX3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SERAC1Q96JX3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SERAC1Q96JX3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SERAC1Q96JX3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SERAC1Q96JX3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SERAC1Q96JX3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SERAC1Q96JX3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SERAC1Q96JX3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SERAC1Q96JX3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SERAC1Q96JX3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SERAC1Q96JX3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SERAC1Q96JX3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SERAC1Q96JX3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SERAC1Q96JX3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SERAC1Q96JX3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SERAC1Q96JX3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SERAC1Q96JX3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SERAC1Q96JX3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SERAC1Q96JX3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SERAC1Q96JX3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SERAC1Q96JX3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SERAC1Q96JX3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SERAC1Q96JX3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SERAC1Q96JX3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SERAC1Q96JX3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SERAC1Q96JX3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SERAC1Q96JX3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SERAC1Q96JX3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SERAC1Q96JX3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SERAC1Q96JX3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SERAC1Q96JX3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SERAC1Q96JX3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SERAC1Q96JX3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SERAC1Q96JX3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SERAC1Q96JX3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SERAC1Q96JX3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SERAC1Q96JX3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SERAC1Q96JX3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SERAC1Q96JX3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SERAC1Q96JX3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SERAC1Q96JX3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SERAC1Q96JX3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SERAC1Q96JX3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SERAC1Q96JX3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SERAC1Q96JX3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SERAC1Q96JX3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SERAC1Q96JX3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SERAC1Q96JX3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SERAC1Q96JX3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SERAC1Q96JX3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SERAC1Q96JX3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SERAC1Q96JX3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SERAC1Q96JX3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SERAC1Q96JX3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SERAC1Q96JX3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SERAC1Q96JX3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SERAC1Q96JX3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SERAC1Q96JX3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SERAC1Q96JX3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SERAC1Q96JX3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SERAC1Q96JX3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SERAC1Q96JX3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SERAC1Q96JX3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SERAC1Q96JX3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SERAC1Q96JX3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SERAC1Q96JX3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SERAC1Q96JX3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SERAC1Q96JX3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SERAC1Q96JX3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SERAC1Q96JX3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SERAC1Q96JX3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SERAC1Q96JX3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms