Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CELF6Q96J87 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CELF6Q96J87 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CELF6Q96J87 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CELF6Q96J87 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CELF6Q96J87 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CELF6Q96J87 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CELF6Q96J87 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CELF6Q96J87 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CELF6Q96J87 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CELF6Q96J87 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CELF6Q96J87 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CELF6Q96J87 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CELF6Q96J87 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CELF6Q96J87 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CELF6Q96J87 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CELF6Q96J87 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CELF6Q96J87 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CELF6Q96J87 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CELF6Q96J87 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CELF6Q96J87 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CELF6Q96J87 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CELF6Q96J87 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CELF6Q96J87 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CELF6Q96J87 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CELF6Q96J87 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CELF6Q96J87 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CELF6Q96J87 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CELF6Q96J87 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CELF6Q96J87 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CELF6Q96J87 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CELF6Q96J87 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CELF6Q96J87 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CELF6Q96J87 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CELF6Q96J87 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CELF6Q96J87 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CELF6Q96J87 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CELF6Q96J87 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CELF6Q96J87 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CELF6Q96J87 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CELF6Q96J87 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CELF6Q96J87 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CELF6Q96J87 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CELF6Q96J87 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CELF6Q96J87 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CELF6Q96J87 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CELF6Q96J87 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CELF6Q96J87 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CELF6Q96J87 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CELF6Q96J87 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CELF6Q96J87 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CELF6Q96J87 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CELF6Q96J87 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CELF6Q96J87 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CELF6Q96J87 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CELF6Q96J87 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CELF6Q96J87 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CELF6Q96J87 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CELF6Q96J87 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CELF6Q96J87 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CELF6Q96J87 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CELF6Q96J87 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CELF6Q96J87 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CELF6Q96J87 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CELF6Q96J87 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CELF6Q96J87 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CELF6Q96J87 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CELF6Q96J87 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CELF6Q96J87 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CELF6Q96J87 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CELF6Q96J87 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CELF6Q96J87 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CELF6Q96J87 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CELF6Q96J87 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CELF6Q96J87 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CELF6Q96J87 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CELF6Q96J87 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CELF6Q96J87 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CELF6Q96J87 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CELF6Q96J87 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CELF6Q96J87 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CELF6Q96J87 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CELF6Q96J87 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CELF6Q96J87 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CELF6Q96J87 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CELF6Q96J87 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CELF6Q96J87 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CELF6Q96J87 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CELF6Q96J87 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CELF6Q96J87 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CELF6Q96J87 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CELF6Q96J87 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CELF6Q96J87 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CELF6Q96J87 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CELF6Q96J87 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CELF6Q96J87 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CELF6Q96J87 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CELF6Q96J87 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CELF6Q96J87 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CELF6Q96J87 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123 ms