Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ5

CLIP3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP3Q96DZ5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CLIP3Q96DZ5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLIP3Q96DZ5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLIP3Q96DZ5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CLIP3Q96DZ5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLIP3Q96DZ5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CLIP3Q96DZ5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLIP3Q96DZ5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CLIP3Q96DZ5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLIP3Q96DZ5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLIP3Q96DZ5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLIP3Q96DZ5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLIP3Q96DZ5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CLIP3Q96DZ5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CLIP3Q96DZ5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLIP3Q96DZ5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLIP3Q96DZ5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CLIP3Q96DZ5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLIP3Q96DZ5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLIP3Q96DZ5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLIP3Q96DZ5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLIP3Q96DZ5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLIP3Q96DZ5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLIP3Q96DZ5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLIP3Q96DZ5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLIP3Q96DZ5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLIP3Q96DZ5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLIP3Q96DZ5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLIP3Q96DZ5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLIP3Q96DZ5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLIP3Q96DZ5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLIP3Q96DZ5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLIP3Q96DZ5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLIP3Q96DZ5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLIP3Q96DZ5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CLIP3Q96DZ5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLIP3Q96DZ5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLIP3Q96DZ5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLIP3Q96DZ5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLIP3Q96DZ5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CLIP3Q96DZ5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLIP3Q96DZ5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CLIP3Q96DZ5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLIP3Q96DZ5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLIP3Q96DZ5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLIP3Q96DZ5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLIP3Q96DZ5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLIP3Q96DZ5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLIP3Q96DZ5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLIP3Q96DZ5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLIP3Q96DZ5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLIP3Q96DZ5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLIP3Q96DZ5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLIP3Q96DZ5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CLIP3Q96DZ5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLIP3Q96DZ5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CLIP3Q96DZ5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLIP3Q96DZ5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLIP3Q96DZ5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLIP3Q96DZ5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLIP3Q96DZ5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLIP3Q96DZ5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLIP3Q96DZ5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLIP3Q96DZ5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLIP3Q96DZ5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLIP3Q96DZ5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLIP3Q96DZ5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLIP3Q96DZ5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLIP3Q96DZ5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLIP3Q96DZ5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLIP3Q96DZ5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLIP3Q96DZ5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLIP3Q96DZ5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLIP3Q96DZ5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CLIP3Q96DZ5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLIP3Q96DZ5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLIP3Q96DZ5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLIP3Q96DZ5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLIP3Q96DZ5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CLIP3Q96DZ5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLIP3Q96DZ5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLIP3Q96DZ5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLIP3Q96DZ5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLIP3Q96DZ5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLIP3Q96DZ5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLIP3Q96DZ5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLIP3Q96DZ5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLIP3Q96DZ5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLIP3Q96DZ5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLIP3Q96DZ5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLIP3Q96DZ5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLIP3Q96DZ5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLIP3Q96DZ5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLIP3Q96DZ5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLIP3Q96DZ5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLIP3Q96DZ5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLIP3Q96DZ5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLIP3Q96DZ5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLIP3Q96DZ5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLIP3Q96DZ5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.6 ms