Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUI4

HDAC7, Histone deacetylase 7, humanhuman

Predictions only

Length 952 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC7Q8WUI4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HDAC7Q8WUI4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HDAC7Q8WUI4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HDAC7Q8WUI4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HDAC7Q8WUI4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
HDAC7Q8WUI4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HDAC7Q8WUI4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
HDAC7Q8WUI4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDAC7Q8WUI4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDAC7Q8WUI4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDAC7Q8WUI4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDAC7Q8WUI4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDAC7Q8WUI4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HDAC7Q8WUI4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HDAC7Q8WUI4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDAC7Q8WUI4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDAC7Q8WUI4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDAC7Q8WUI4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDAC7Q8WUI4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDAC7Q8WUI4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDAC7Q8WUI4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HDAC7Q8WUI4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
HDAC7Q8WUI4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
HDAC7Q8WUI4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HDAC7Q8WUI4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HDAC7Q8WUI4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HDAC7Q8WUI4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HDAC7Q8WUI4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HDAC7Q8WUI4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HDAC7Q8WUI4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HDAC7Q8WUI4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HDAC7Q8WUI4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HDAC7Q8WUI4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HDAC7Q8WUI4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HDAC7Q8WUI4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HDAC7Q8WUI4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HDAC7Q8WUI4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HDAC7Q8WUI4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HDAC7Q8WUI4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HDAC7Q8WUI4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HDAC7Q8WUI4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HDAC7Q8WUI4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HDAC7Q8WUI4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HDAC7Q8WUI4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HDAC7Q8WUI4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HDAC7Q8WUI4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HDAC7Q8WUI4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HDAC7Q8WUI4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HDAC7Q8WUI4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HDAC7Q8WUI4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HDAC7Q8WUI4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
HDAC7Q8WUI4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
HDAC7Q8WUI4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
HDAC7Q8WUI4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HDAC7Q8WUI4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HDAC7Q8WUI4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HDAC7Q8WUI4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HDAC7Q8WUI4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HDAC7Q8WUI4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HDAC7Q8WUI4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
HDAC7Q8WUI4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HDAC7Q8WUI4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HDAC7Q8WUI4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HDAC7Q8WUI4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HDAC7Q8WUI4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HDAC7Q8WUI4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HDAC7Q8WUI4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HDAC7Q8WUI4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HDAC7Q8WUI4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HDAC7Q8WUI4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HDAC7Q8WUI4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HDAC7Q8WUI4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HDAC7Q8WUI4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HDAC7Q8WUI4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HDAC7Q8WUI4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HDAC7Q8WUI4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HDAC7Q8WUI4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HDAC7Q8WUI4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HDAC7Q8WUI4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HDAC7Q8WUI4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HDAC7Q8WUI4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HDAC7Q8WUI4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HDAC7Q8WUI4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HDAC7Q8WUI4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HDAC7Q8WUI4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
HDAC7Q8WUI4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HDAC7Q8WUI4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HDAC7Q8WUI4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HDAC7Q8WUI4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HDAC7Q8WUI4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HDAC7Q8WUI4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HDAC7Q8WUI4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HDAC7Q8WUI4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HDAC7Q8WUI4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HDAC7Q8WUI4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HDAC7Q8WUI4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HDAC7Q8WUI4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HDAC7Q8WUI4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDAC7Q8WUI4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDAC7Q8WUI4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms