Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHY6

ZFP28, Zinc finger protein 28 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFP28Q8NHY6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZFP28Q8NHY6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZFP28Q8NHY6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZFP28Q8NHY6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ZFP28Q8NHY6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ZFP28Q8NHY6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ZFP28Q8NHY6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZFP28Q8NHY6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZFP28Q8NHY6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZFP28Q8NHY6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZFP28Q8NHY6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZFP28Q8NHY6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZFP28Q8NHY6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZFP28Q8NHY6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZFP28Q8NHY6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZFP28Q8NHY6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZFP28Q8NHY6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZFP28Q8NHY6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZFP28Q8NHY6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZFP28Q8NHY6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZFP28Q8NHY6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZFP28Q8NHY6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ZFP28Q8NHY6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZFP28Q8NHY6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZFP28Q8NHY6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZFP28Q8NHY6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZFP28Q8NHY6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZFP28Q8NHY6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZFP28Q8NHY6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZFP28Q8NHY6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZFP28Q8NHY6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZFP28Q8NHY6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZFP28Q8NHY6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZFP28Q8NHY6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZFP28Q8NHY6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZFP28Q8NHY6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZFP28Q8NHY6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZFP28Q8NHY6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ZFP28Q8NHY6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZFP28Q8NHY6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZFP28Q8NHY6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZFP28Q8NHY6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZFP28Q8NHY6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZFP28Q8NHY6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZFP28Q8NHY6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZFP28Q8NHY6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZFP28Q8NHY6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZFP28Q8NHY6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZFP28Q8NHY6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZFP28Q8NHY6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZFP28Q8NHY6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZFP28Q8NHY6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZFP28Q8NHY6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZFP28Q8NHY6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZFP28Q8NHY6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZFP28Q8NHY6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZFP28Q8NHY6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ZFP28Q8NHY6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZFP28Q8NHY6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZFP28Q8NHY6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZFP28Q8NHY6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZFP28Q8NHY6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZFP28Q8NHY6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZFP28Q8NHY6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZFP28Q8NHY6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZFP28Q8NHY6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZFP28Q8NHY6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZFP28Q8NHY6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZFP28Q8NHY6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZFP28Q8NHY6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZFP28Q8NHY6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZFP28Q8NHY6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZFP28Q8NHY6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZFP28Q8NHY6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZFP28Q8NHY6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZFP28Q8NHY6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZFP28Q8NHY6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZFP28Q8NHY6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZFP28Q8NHY6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZFP28Q8NHY6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZFP28Q8NHY6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZFP28Q8NHY6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZFP28Q8NHY6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZFP28Q8NHY6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZFP28Q8NHY6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZFP28Q8NHY6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZFP28Q8NHY6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZFP28Q8NHY6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZFP28Q8NHY6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZFP28Q8NHY6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZFP28Q8NHY6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZFP28Q8NHY6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZFP28Q8NHY6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZFP28Q8NHY6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZFP28Q8NHY6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZFP28Q8NHY6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZFP28Q8NHY6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZFP28Q8NHY6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZFP28Q8NHY6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZFP28Q8NHY6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms