Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS7

SLC44A5, Choline transporter-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A5Q8NCS7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC44A5Q8NCS7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC44A5Q8NCS7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC44A5Q8NCS7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC44A5Q8NCS7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC44A5Q8NCS7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC44A5Q8NCS7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC44A5Q8NCS7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLC44A5Q8NCS7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLC44A5Q8NCS7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC44A5Q8NCS7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC44A5Q8NCS7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC44A5Q8NCS7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC44A5Q8NCS7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC44A5Q8NCS7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC44A5Q8NCS7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC44A5Q8NCS7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC44A5Q8NCS7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC44A5Q8NCS7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC44A5Q8NCS7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC44A5Q8NCS7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC44A5Q8NCS7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC44A5Q8NCS7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC44A5Q8NCS7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC44A5Q8NCS7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC44A5Q8NCS7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC44A5Q8NCS7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC44A5Q8NCS7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC44A5Q8NCS7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC44A5Q8NCS7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC44A5Q8NCS7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC44A5Q8NCS7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC44A5Q8NCS7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC44A5Q8NCS7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC44A5Q8NCS7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC44A5Q8NCS7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC44A5Q8NCS7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC44A5Q8NCS7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC44A5Q8NCS7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC44A5Q8NCS7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC44A5Q8NCS7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC44A5Q8NCS7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC44A5Q8NCS7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC44A5Q8NCS7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC44A5Q8NCS7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC44A5Q8NCS7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC44A5Q8NCS7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC44A5Q8NCS7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC44A5Q8NCS7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC44A5Q8NCS7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC44A5Q8NCS7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC44A5Q8NCS7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC44A5Q8NCS7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC44A5Q8NCS7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC44A5Q8NCS7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC44A5Q8NCS7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC44A5Q8NCS7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC44A5Q8NCS7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC44A5Q8NCS7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC44A5Q8NCS7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC44A5Q8NCS7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC44A5Q8NCS7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC44A5Q8NCS7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC44A5Q8NCS7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC44A5Q8NCS7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC44A5Q8NCS7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC44A5Q8NCS7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC44A5Q8NCS7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC44A5Q8NCS7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC44A5Q8NCS7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SLC44A5Q8NCS7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SLC44A5Q8NCS7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SLC44A5Q8NCS7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC44A5Q8NCS7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC44A5Q8NCS7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC44A5Q8NCS7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC44A5Q8NCS7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLC44A5Q8NCS7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLC44A5Q8NCS7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLC44A5Q8NCS7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLC44A5Q8NCS7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLC44A5Q8NCS7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLC44A5Q8NCS7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC44A5Q8NCS7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC44A5Q8NCS7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC44A5Q8NCS7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC44A5Q8NCS7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC44A5Q8NCS7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC44A5Q8NCS7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC44A5Q8NCS7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC44A5Q8NCS7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC44A5Q8NCS7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC44A5Q8NCS7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC44A5Q8NCS7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC44A5Q8NCS7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SLC44A5Q8NCS7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SLC44A5Q8NCS7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC44A5Q8NCS7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC44A5Q8NCS7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC44A5Q8NCS7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.2 ms