Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLDN19Q8N6F1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLDN19Q8N6F1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN19Q8N6F1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN19Q8N6F1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN19Q8N6F1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN19Q8N6F1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN19Q8N6F1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN19Q8N6F1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN19Q8N6F1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN19Q8N6F1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN19Q8N6F1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN19Q8N6F1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN19Q8N6F1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN19Q8N6F1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN19Q8N6F1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLDN19Q8N6F1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLDN19Q8N6F1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLDN19Q8N6F1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLDN19Q8N6F1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDN19Q8N6F1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDN19Q8N6F1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDN19Q8N6F1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDN19Q8N6F1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDN19Q8N6F1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDN19Q8N6F1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDN19Q8N6F1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDN19Q8N6F1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDN19Q8N6F1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDN19Q8N6F1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDN19Q8N6F1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDN19Q8N6F1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDN19Q8N6F1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDN19Q8N6F1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDN19Q8N6F1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDN19Q8N6F1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDN19Q8N6F1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDN19Q8N6F1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN19Q8N6F1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN19Q8N6F1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN19Q8N6F1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN19Q8N6F1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN19Q8N6F1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN19Q8N6F1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN19Q8N6F1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN19Q8N6F1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN19Q8N6F1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN19Q8N6F1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN19Q8N6F1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN19Q8N6F1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN19Q8N6F1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN19Q8N6F1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN19Q8N6F1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN19Q8N6F1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLDN19Q8N6F1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLDN19Q8N6F1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLDN19Q8N6F1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLDN19Q8N6F1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDN19Q8N6F1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDN19Q8N6F1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDN19Q8N6F1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDN19Q8N6F1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDN19Q8N6F1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDN19Q8N6F1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDN19Q8N6F1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDN19Q8N6F1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDN19Q8N6F1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDN19Q8N6F1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDN19Q8N6F1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDN19Q8N6F1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLDN19Q8N6F1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLDN19Q8N6F1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN19Q8N6F1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN19Q8N6F1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDN19Q8N6F1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDN19Q8N6F1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDN19Q8N6F1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDN19Q8N6F1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDN19Q8N6F1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLDN19Q8N6F1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLDN19Q8N6F1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLDN19Q8N6F1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLDN19Q8N6F1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLDN19Q8N6F1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN19Q8N6F1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN19Q8N6F1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN19Q8N6F1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN19Q8N6F1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN19Q8N6F1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN19Q8N6F1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN19Q8N6F1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDN19Q8N6F1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDN19Q8N6F1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDN19Q8N6F1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDN19Q8N6F1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLDN19Q8N6F1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLDN19Q8N6F1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLDN19Q8N6F1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLDN19Q8N6F1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLDN19Q8N6F1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.1 ms