Protein–RNA interactions for Protein: Q8N456

LRRC18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC18Q8N456 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC18Q8N456 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC18Q8N456 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC18Q8N456 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC18Q8N456 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC18Q8N456 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC18Q8N456 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC18Q8N456 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC18Q8N456 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC18Q8N456 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC18Q8N456 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC18Q8N456 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC18Q8N456 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC18Q8N456 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC18Q8N456 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC18Q8N456 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC18Q8N456 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC18Q8N456 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRRC18Q8N456 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRRC18Q8N456 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRRC18Q8N456 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC18Q8N456 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC18Q8N456 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC18Q8N456 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC18Q8N456 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC18Q8N456 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC18Q8N456 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC18Q8N456 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC18Q8N456 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC18Q8N456 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC18Q8N456 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC18Q8N456 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC18Q8N456 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC18Q8N456 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC18Q8N456 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC18Q8N456 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC18Q8N456 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC18Q8N456 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC18Q8N456 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC18Q8N456 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC18Q8N456 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC18Q8N456 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC18Q8N456 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC18Q8N456 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC18Q8N456 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC18Q8N456 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC18Q8N456 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC18Q8N456 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC18Q8N456 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC18Q8N456 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC18Q8N456 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRC18Q8N456 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRC18Q8N456 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC18Q8N456 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC18Q8N456 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC18Q8N456 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC18Q8N456 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC18Q8N456 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC18Q8N456 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC18Q8N456 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC18Q8N456 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC18Q8N456 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC18Q8N456 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC18Q8N456 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC18Q8N456 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC18Q8N456 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC18Q8N456 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC18Q8N456 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC18Q8N456 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC18Q8N456 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC18Q8N456 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC18Q8N456 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC18Q8N456 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC18Q8N456 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC18Q8N456 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC18Q8N456 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC18Q8N456 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC18Q8N456 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC18Q8N456 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC18Q8N456 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC18Q8N456 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC18Q8N456 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC18Q8N456 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC18Q8N456 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC18Q8N456 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC18Q8N456 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC18Q8N456 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC18Q8N456 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC18Q8N456 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC18Q8N456 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC18Q8N456 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC18Q8N456 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC18Q8N456 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC18Q8N456 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC18Q8N456 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC18Q8N456 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC18Q8N456 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC18Q8N456 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC18Q8N456 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC18Q8N456 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms