Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC83Q8IWF9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC83Q8IWF9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC83Q8IWF9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC83Q8IWF9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC83Q8IWF9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC83Q8IWF9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC83Q8IWF9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC83Q8IWF9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC83Q8IWF9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC83Q8IWF9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC83Q8IWF9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC83Q8IWF9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC83Q8IWF9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC83Q8IWF9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC83Q8IWF9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC83Q8IWF9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC83Q8IWF9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC83Q8IWF9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC83Q8IWF9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC83Q8IWF9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC83Q8IWF9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC83Q8IWF9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC83Q8IWF9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC83Q8IWF9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC83Q8IWF9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC83Q8IWF9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC83Q8IWF9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC83Q8IWF9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC83Q8IWF9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC83Q8IWF9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC83Q8IWF9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC83Q8IWF9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC83Q8IWF9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC83Q8IWF9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC83Q8IWF9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC83Q8IWF9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC83Q8IWF9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC83Q8IWF9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CCDC83Q8IWF9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC83Q8IWF9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC83Q8IWF9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC83Q8IWF9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC83Q8IWF9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC83Q8IWF9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC83Q8IWF9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC83Q8IWF9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC83Q8IWF9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC83Q8IWF9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC83Q8IWF9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC83Q8IWF9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC83Q8IWF9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC83Q8IWF9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC83Q8IWF9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC83Q8IWF9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC83Q8IWF9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC83Q8IWF9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC83Q8IWF9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC83Q8IWF9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC83Q8IWF9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC83Q8IWF9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC83Q8IWF9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC83Q8IWF9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC83Q8IWF9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC83Q8IWF9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC83Q8IWF9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC83Q8IWF9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC83Q8IWF9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC83Q8IWF9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC83Q8IWF9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC83Q8IWF9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC83Q8IWF9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC83Q8IWF9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC83Q8IWF9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC83Q8IWF9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC83Q8IWF9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC83Q8IWF9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC83Q8IWF9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC83Q8IWF9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC83Q8IWF9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC83Q8IWF9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC83Q8IWF9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC83Q8IWF9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC83Q8IWF9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC83Q8IWF9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC83Q8IWF9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC83Q8IWF9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC83Q8IWF9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC83Q8IWF9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC83Q8IWF9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC83Q8IWF9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC83Q8IWF9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC83Q8IWF9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC83Q8IWF9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC83Q8IWF9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC83Q8IWF9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC83Q8IWF9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC83Q8IWF9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC83Q8IWF9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC83Q8IWF9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms